一、个人所得税手续费的相关法规：
1、根据《个人所得税法》第十一条规定，对扣缴义务人按照所扣缴的税款，付给百分之二的手续费。
2、《财政部、国家税务总局、中国人民银行关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》（财行[2005]365号）规定，“三代”范围 包括代扣代缴、代收代缴、委托代征，“三代”税款手续费支付比例，(一)法律、行政法规规定的代扣代缴、代收代缴税款，税务机关按代扣、代收税款的2％支付。
二、个人所得税手续费征收增值税：
目前没出台涉及个税手续费返还缴纳增值税的具体文件，但在税务总局及地方税务局的12366纳税服务平台答疑上有所反映：
总局口径：国家税务总局12366纳税服务平台2017年01月17日答疑，是“按照目前营改增政策相关规定，纳税人代扣代缴个人所得税取得的手续费收入应属于增值税征税范围，应缴纳增值税。”
地方口径：目前就营改增后个人所得税手续费返还明确征收增值税的地区只有部分省份（并非全部省份），其中包含安徽省，按照“商务辅助服务—代理经纪服务”缴纳增值税。（注：适用于所在地区的所有公司）
安徽国税，12366咨询热点问答解答（2016年9月）问题三、企业为员工代扣代缴个人所得税，税务机关返还的代扣代缴收入是否缴纳增值税？
答：代扣代缴个人所得税的手续费返还应按照“商务辅助服务—代理经纪服务”缴纳增值税。经纪代理服务，是指各类经纪、中介、代理服务。包括金融代理、知识产权代理、货物运输代理、代理报关、法律代理、房地产中介、职业中介、婚姻中介、代理记账、拍卖等。
文件依据：《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税[2016]36号）货劳处审核人：丁以文
三、个人所得税手续费企业所得税处理：
根据《中华人民共和国企业所得税法》和《中华人民共和国企业所得税法实施条例》的有关规定，企业代扣代缴个人所得税取得手续费收入应缴纳企业所得税。中华人民共和国企业所得税法》第六条规定，企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入，为收入总额。
对于企业取得的该项手续费返还收入应计入企业所得税收入中，对于用于该项工作的支出也同时计入到支出中，参与企业收到当年企业所得税汇算清缴。因此手续费返还收入企业所得税肯定是要缴的。
四、个人所得税手续费个税处理：
《财政部国家税务总局关于个人所得税若干政策问题的通知》（财税字[1994]20号）“二、下列所得，暂免征收个人所得税：（五）个人办理代扣代缴税款手续，按规定取得的扣缴手续费。”对于免征个人所得税的手续费也应仅指办理代扣代缴手续的相关人员按规定所取得的扣缴手续费，而如果公司将此款项作为奖金或者集体福利性质奖励给非相关人员则应并入员工当期工资薪金计征个人所得税。
五、个人所得税手续费账务处理
建议纳税人将手续续返还收入计入“其他业务收入”，如用于奖励办税人员发生支出时计入“其他业务支出”科目。
借：银行存款
贷：其他业务收入
应交税费-增值税（销项税）
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