首先，系统科学探索各种科学中“系统”(systems)和“系统性”(systemhood)的理论和科学，是将各种自然、人工系统的运作规律进行数学化的尝试。说到头，系统科学的发展主要是由于广义的工程科学的发展，它适应了有关现代技术、人机关系、程序设计等等“系统”的复杂性的要求。说白了，现代工程已经不是一两台动力机器的简单工程了，而是很多类控制型机器、人机交织的复杂工程了，底层的科学理论被迫向“系统级”、“复杂性”进化。
因为太宏大、同时又深刻，系统科学好像并没有真正作为一门专业学科在社会上建立起来。相反，系统工程从贝尔实验室开始起就在国防、航宇等重大产业中逐渐成为行为惯例。不过呢，现实中的系统工程说到底还是工程，对系统科学、系统理论、系统思维的重视与采纳程度都不够。难怪一般系统论创始人贝塔朗菲对此颇有微词：
注意流行概念和时髦用语的人会发现，现在“系统”很吃香。系统的概念已经普及到一切科学领域并已渗透到日常的思维、言谈和一般性宣传之中。系统思想在从生产企业、军队到纯科学的深奥课题的广阔领域中起着支配的作用……最近几年出现了许多以系统设计、系统分析、系统工程等等命名的职业和工作，这些在不久前人们还一无所知。
——《一般系统论》（1987年版）
原则上，系统科学和系统工程一奶同胞，都是基于现代工程的复杂性而产生的。直觉性的原则上，系统工程应该是系统科学在工程领域的应用，只不过现实中是两张皮——A说B是我的附庸，B说A
是我的子集。系统科学如今已演化成复杂性科学，原先的众多源流（老三论、新三论、博弈论、网络理论、群论……）逐渐聚合在计算主义的大旗下，前途还是很光明滴，就是曲高和寡。系统工程虽然是实践指导性很强的方法论，但在工业领域之外用得也不多，普及道路同样任重道远。
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系统科学与系统工程的区别与联系是怎样的？ - 图文
