2014年3月13日，央行下发紧急文件《中国人民银行支付结算司关于暂停支付宝公司线下条码(二维码)支付等业务意见的函》，暂停支付宝、腾讯的虚拟信用卡产品，同时叫停的还有条码(二维码)支付等面对面支付服务，并要求支付宝、财付通将有关产品详细介绍、管理制度、操作流程等情况上报 。二维码支付的安全性问题引起了社会的极大关注。
对此，相应的二维码支付软硬件厂商都在积极提出自己的安全解决方案，2014年4月9日，支付宝在北京宣布将联合多方共建安全基金，首批投入4000万元。同时，支付宝还表示，将在即将面世的支付宝钱包8.1版本中，推出设备管理、短信保护等功能。
“2014年度，我们会投入4000万元用于我们的安全基金的联盟建设，主要包括了反木马的基金。”小微金融服务集团(筹)副总裁、首席风险官胡晓明称，这4000万元的基金，主要投向反钓鱼联防、反木马联防、反洗钱、反恶意攻击、用户信息保护等领域。
二维码支付硬件厂家也从三方面提出了安全解决方案。首先，从硬件方面，微pos的硬件有自我保护的能力，若是被强拆，微pos内的芯片
会自行烧毁，防止有人试图篡改pos机系统;其次，微pos的系统是基于Android进行了必要的删减和封装形成，不存在多余的功能，这也保证了系统不被恶意软件侵染;最后，微pos机在处理数据时都会进行信息加密，保证交易数据不外泄。
在推动行业规范发展方面，中国人民银行将二维码支付定位于小额、便捷和银行卡支付的有效补充，并采取了一系列措施规范二维码支付业务的开展。其中包括确立了依据业务实质，无论是商业银行还是支付机构、使用银行账户还是支付账户开展二维码支付，均应根据交易验证安全等级、通过交易额度进行风险控制和安全管理的监管思路。
再完美的支付体系也有可能被人利用来非法获利，并且无论是二维码支付还是其它支付方式都会存在自身不可规避的风险，对于使用者来说，一定要加强自我防范意识，多了解相关知识信息。例如，作为消费者，不要见码就扫，也不要随意把收款码这些有关财产的信息发送给他人；作为商户，在放置二维码时，要保证在可视范围内，防止被恶意替换等。
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二维码支付存在的安全问题
