分子生物学
第一章绪论
分子生物学研究内容有哪些方面？
1、结构分子生物学； 2、基因表达的调节与控制； 3、DNA 重组技术及其应用； 4、结构 基因组学、功能基因组学、生物信息学、系统生物学
第二章 DNA and Chromosome
1、DNA 的变性：在某些理化因素作用下， DNA 双链解开成两条单链的过程。
2、DNA 复性：变性 DNA 在适当条件下，分开的两条单链分子按照碱基互补原则重新恢复天 然的双螺旋构象的现象。
3、 Tm（熔链温度）:DNA加热变性时，紫外吸收达到最大值的一半时的温度，即 DNA分子 内 50%的双链结构被解开成单链分子时的温度）
4、 退火：热变性的 DNA 经缓慢冷却后即可复性，称为退火
5、 假基因：基因组中存在的一段与正常基因非常相似但不能表达的 DNA序列。以屮来表示。 6 C值矛盾或C值悖论:C值的大小与生物的复杂度和进化的地位并不一致，称为 C值矛盾 或 C 值悖论（C-Value Paradox。
7 、转座：可移动因子介导的遗传物质的重排现象。
8、 转座子：染色体、质粒或噬菌体上可以转移位置的遗传成分
9、 DNA二级结构的特点：1） DNA分子是由两条相互平行的脱氧核苷酸长链盘绕而成； 2） DNA 分子中的脱氧核苷酸和磷酸交替连接，排在外侧，构成基本骨架，碱基排列在外侧； 3） DNA分子表面有大沟和小沟；4）两条链间存在碱基互补，通过氢键连系，且A=T G三C （碱 基互补原则）；5）螺旋的螺距为3.4nm,直径为2nm相邻两个碱基对之间的垂直距离为 0.34nm, 每圈螺旋包含 10个碱基对； 6）碱基平面与螺旋纵轴接近垂直，糖环平面接近平行 10、 真核生物基因组结构：编码蛋白质或RNA勺编码序列和非编码序列，包括编码区两侧的调 控序列和编码序列间的间隔序列。
特点：1）真核基因组结构庞大 哺乳类生物大于2X109bp； 2）单顺反子（单顺反子：一 个基因单独转录，一个基因一条 mRNA翻译成一条多肽链；）3）基因不连续性 断裂基因 （interrupted gene ）、内含子（intron）、 外显子（exon） ； 4）非编码区较多，多于编码序 列（9:1） 5 ）含有大量重复序列 11、 Histon（ 组蛋白）特点：极端保守性、无组织特异性、氨基酸分布的不对称性、可修饰作 用、富含 Lys 的 H5 12、 核小体组成： 由组蛋白和200bp DNA组成
13、 转座的机制：转座时发生的插入作用有一个普遍的特征， 那就是受体分子中有一段很短的 被称为靶序列的DNA会被复制，使插入的转座子位于两个重复的靶序列之间。
复制型转座：整个转座子被复制，所移动和转位的仅为原转座子的拷贝。 非复制型转座：原始转座子作为一个可移动的实体直接被移位。
第三章 DNA Replication and repair
1、半保留复制：DNA生物合成时，母链DNA解开为两股单链，各自作为模板（template）按碱
基配对规律，合成与模板互补的子链。子代细胞的 DNA 一股单链从亲代完整地接受过来，另 一股单链则完全从新合成。两个子细胞的DNA都和亲代DNA碱基序列一致。这种复制方式称为 半保留复制。
2、 复制子：生物体内能独立进行复制的单位
3、 前导链：以复制叉移动的方向为标准，一条模板链的走向是 3'f 5',子代链复制时以 5'一 3'方向连续合成，这一条链称为前导链
4、 滞后链：另一条模板链的走向是5'一3'，子代链通过不连续的5/-3 /聚合而成，称 为滞后链(lagging strand) 。
5、 冈崎片段：滞后链的合成是一段一段的。DNAS制时，由滞后链所形成的子代 DNA短链称 为冈崎片段
6、 端粒：是真核生物线性染色体末端的特殊结构， 含物种特异性(species-specific )的DNA 重复序列。
7、 逆转录：以RNA为模板，按照RNA中的核苷酸顺序合成DNA勺过程，称为反转录(reverse tran scripti on, RT) 。该过程由逆转录酶催化进行，亦称反转录
8、 DNA复制的主要特征：半保留复制、 双向复制、 半不连续复制、 保真性 9、 DNAS制的几种方式：
(unidirectional) n
如蜿奮(adenovirus)
环状DMA 欢迎下载 0 形:如 E. coli 取向(bidirectional) 滚｝裡(rolling circle):Jffl 单向(unidirectional) DH^(D-loop):如动物线粒体DN/V Mostly,双向等速！ 10、DNA polymerases (DNA 聚合酶)in E. Coli 及其主要功能 2 表 E coif D NA聚合酶性质的比较 Pel 1 Pol II Pol III 5^-3^ Poi + + + + — 3-5'exo 5* -3Jexo + — 新生锂合成 忙物学活性 结 — — 十 15 pol C 1 pol A 0.05 pc/ B 三种酶均有:T ■亍外切酶活性，说明均有校正功能 DNA Pol IV: din B 编码 DNA Pol V: umc C, umc D 编码 两者涉及DNA的错误倾向修复 （error-prone repair）。当DNA受到较严重损伤时，即可诱导产生这两个酶， 使修复缺乏准确性（accuracy），因而出现高突变率。高突变率虽会杀死许多细胞， 使少数突变的细胞得以存活。 但至少可以克服复制障碍, 11、 单链DNA结合蛋白（SSB）：在复制中维持模板处于单链状态并保护单链的完整。其 作用是保证被解链酶解开的单链在复制完成之前能保持单链结构。 12、 常见的真核细胞DNA聚合酶及其功能 DNA-pol a DNA-pol 起始引发，有引物酶活性。 高保真修复酶”碱基切除修复- 在线粒体DNAM制中起催化作用. DNA-pol DNA-pol & 延长子赞的主要酶，有解螺旅酶活性? DNA-pol 参与合成后随链，在复制过程中起校 读.修复和填补缺口的作用。 E.coli，DnaA蛋白识别并结合ori， DnaC协助DnaB 13、原核生物DNA复制的过程（课本 P50-P52） 1）复制的起始：识别起始点，合成引发体：在 蛋白（解链酶，helicase）结合于ori , DNA双链局部被打开，引物酶及其他蛋白加入，形成引发体。 形成单链：促旋酶（II型拓扑异构酶）解开 DNA超螺旋，解链酶解开双链，单链结合蛋白 SSB结合 于处于单链状态模板链上。 合成引物：前导链 的引物由RNA聚合酶合成，滞后链的引物由引发酶合成 制 进 入 延 伸 。引物提供3' -OH，复 阶 段 2）复制的延伸:按照与模板链碱基配对的原则， 在DNA聚合酶III的作用下，逐个加入脱氧核糖核酸， 使链延 欢迎下载 3
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