GeneMapper软件 微卫星分析中文简易操作手册
微卫星分析流程:
设定微卫星分析方法: 1. 登录软件
2. 创建分析所需kit、panel和marker等参数; 3. 创建新文件,导入数据; 4. 设置分析参数; 5. 执行初始分析; 分析并检查结果: 1. 编辑分析方法; 2. 分析数据; 3. 查看结果; 打印并导出数据(可选): 1. 打印结果; 2. 导出结果。 软件术语介绍:
术语 Analysis Parameters bin bin set marker panel kit 定义 软件中分析样品所使用的特定设置;用于计算片段大小和基因 型,这些特定设置包括analysis method, size standard 和panel 在marker 内设定等位基因的片段大小和颜色 等位基因特定实验条件下一组bin 微卫星标记,通过位点名称、片段大小、荧光标记和重复长度 进行设定 Marker组合 panel 组合
一.设定微卫星分析方法: 1. 登录GeneMapper软件:
1.1 选择开始-- All Programs -- Applied Biosystems -- GeneMapper--GeneMapper;或双击桌面快捷方式
1.2 登录GeneMapper软件:用户名默认为gm,在Passwprd中输入密码,点击OK进入GeneMapper软件
打开软件;
2 创建分析所需kit、panel和marker等参数: 2.1 点击软件上方工具栏Tools,选择Panel Manager;
2.2 在Panel Manager对话框中,选中1 Panel Manager,点击2 新建 Kit;于
New Kit对话框中依次输入Kit名称,Kit类型,并点击OK保存设置;
2.3 在Panel Manager对话框中,选中1 STR KIT,点击2 新建 Panel;3中输入
Panel名称;
2.4 选中1 STR panel,点击2新建Marker,在3位置依次输入Marker Name
(Marker名称),Dye Color (荧光标记种类),Min Size,Max Size (片段最小值和最大值) ,Marker Repeat (重复次数);
2.5 重复2.4步骤,完成所有Marker设置,点击OK保存;
3. 创建新文件,导入数据:
3.1 点击1 新建文件夹,在2Project Type中文件夹类型选择Microsatellite ,点击OK;
3.2 导入数据:点击1 Add Samples To Project 添加数据,在弹出的对话框中选择
待分析数据,通过3 Add To List 添加到右边的面板中,点击4 Add完成数据添加;
4. 设置分析参数:
4.1 完成数据添加后,在1 位置,Analysis Method中选择New Analysis Method
新建分析方法;在弹出的对话框中选择分析类型2 Microsatellite,点击OK确认;