大肠杆菌ERIC-PCR分子分型方法的建立及其初步应用
张辉;杨振泉;赵隽;魏瑞成;王冉
【期刊名称】《江苏农业学报》 【年(卷),期】2010(026)005
【摘要】为建立高效、敏感的肠杆菌科基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)的分子分型方法,该研究提取大肠杆菌基因组DNA,以此为模板建立和优化ERIC-PCR分型体系,并采用ERIC-PCR方法对62株大肠杆菌进行分子分型和遗传相似性统计分析.结果显示从提取的大肠杆菌基因组中能够扩增到 2～8条DNA片段,且大部分片段在 100 bp至 2 000 bp之间.通过4因素3水平正交试验,建立了较为稳定的ERIC-PCR分型方法.利用ERIC-PCR方法可将62株菌分为20型,其中以A型为优势菌群.遗传相似性结果表明,各菌株之间遗传相似性有较大的变化,但部分菌株高度同源.聚类分析表明,ERIC-PCR的分辨率系数为0.937,具有较高的分辨能力.表明应用ERIC-PCR分型技术在分子水平上对大肠杆菌进行鉴别和分型,具有简便和分辨力高等优点,能够对病原进行溯源分析,在大肠杆菌的分子流行病学研究中具有广泛的应用前景. 【总页数】6页(1098-1103)
【关键词】大肠杆菌;ERIC-PCR;分子分型 【作者】张辉;杨振泉;赵隽;魏瑞成;王冉
【作者单位】江苏省农业科学院农业部食品安全监控重点开放实验室,江苏省食品质量安全重点实验室--省部共建国家重点实验室培育基地,江苏省畜禽产品安全性研究重点实验室,江苏,南京,210014;扬州大学食品科学与工程学院,江苏,扬州,225009;扬州大学生物科学与技术学院,江苏,扬州,225009;江苏省农业科学院
农业部食品安全监控重点开放实验室,江苏省食品质量安全重点实验室--省部共建国家重点实验室培育基地,江苏省畜禽产品安全性研究重点实验室,江苏,南京,210014;江苏省农业科学院农业部食品安全监控重点开放实验室,江苏省食品质量安全重点实验室--省部共建国家重点实验室培育基地,江苏省畜禽产品安全性研究重点实验室,江苏,南京,210014 【正文语种】中文 【中图分类】S182 【相关文献】
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大肠杆菌ERIC-PCR分子分型方法的建立及其初步应用
