第7章
蛋白质分离、纯化和表征
第七章
1.掌握蛋白质的酸碱性质。
2.掌握测定蛋白质相对分子质量的常用方法。
3.掌握蛋白质的胶体性质与蛋白质沉淀的方法和原理。 4.掌握蛋白质分离纯化的一般原则。 5.熟悉蛋白质分离纯化的常用方法。
6.掌握蛋白质含量测定与纯度鉴定的常用方法。
第七章作业
1.测得一种血红素蛋白含0.426%铁,计算其最低相对分子质量。一种纯酶按重量计算含亮氨酸1.65%和异亮氨酸2.48%,问其最低相对分子质量是多少?
2.超速离心机的转速为58000r/min时,(1)计算角速度w,以每秒的弧度(rad/s)表示;(2)计算距旋转中心6.2cm处的离心加速度a;(3)此离心加速度相当于重力加速度“g”的多少倍?
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3.一种蛋白质的偏微比容为0.707cm/g;当温度校正为水时,扩散系数(D20,w)为
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13.1×10-7cm/s;沉降系数(D20,w)为2.05 S,20℃时水的密度为0.998g/cm。根据斯维德贝格公式计算该蛋白质的相对分子质量。
4.指出从分子排阻层析柱上洗脱下列蛋白质时的顺序。分离蛋白质的范围是5000到400000:肌红蛋白,过氧化氢酶,细胞色素c,肌球蛋白,胰凝乳蛋白酶原和血清清蛋白(它们的Mr,见表7-4)。
5.在第4题中所述的从分子排阻层析柱上洗脱细胞色素c,β-乳球蛋白,未知蛋白和血红蛋白时,其洗脱体积分别为118,58,37和24ml,问未知蛋白的Mr是多少?假定所有蛋白质都是球形的,并且都处在柱的分级分离范围内。
6.在下面指出的pH下,下述蛋白质在电场中向哪个方向移动,即向正极,负极还是不动?(根据表7-2的数据判断)。(1)卵清蛋白,在PH5.0;(2)β-乳球蛋白,在PH 5.0和7.0;(3)胰凝乳蛋白酶原,在PH5.0,9.1和11。
7.(1)当Ala,Ser,Phe,Leu,Arg,Asp和His的混合物在PH3.9进行纸电泳时,哪些氨基酸移向正极?哪些氨基酸移向负极?
(2)纸电泳时,带有相同电荷的氨基酸常有少许分开,例如Gly可与Leu分开。试说明为什么?
(3)设Ala,Val,Glu,Lys和Thr的混合物PH为6.0,试指出纸电泳后氨基酸的分离情况。
8.配置一系列牛血清清蛋白(BSA)稀释液,每一种溶液取0.1ml进行Bradford法测定。对适当的空白测定595nm波长处的光吸收(A595)。结果如下表所示:
BSA的浓度/(mg×mL-1) A595 1.5 1.0 0.8 0.6 1.4 0.97 0.79 0.59
0.4 0.37 0.2 0.17 BSA浓度对A595作图得标准曲线。E.coli的蛋白质提取液样品(0.1ml)测得的A595的0.84。根据标准曲线算出E.coli提取液中的蛋白质浓度。
9.今有一种植物的毒素蛋白。直接用SDS凝胶电泳分析(见第7章)时,它的区带位于肌红蛋白(相对分子质量为16900)和β-乳球蛋白(相对分子质量37100)两种蛋白之间,当这个毒素蛋白用β-巯基乙醇和碘乙酸处理后,在SDS凝胶电泳中仍得到一条区带,但其位置靠近标记蛋白细胞色素c(相对分子质量为13370)。进一步实验表明,该毒素蛋白与FDNB反应并酸水解后,释放出游离的DNP-Gly和DNP-Tyr。关于此蛋白的结构,你能作出什么结论?
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各个解离基团的pK值与游离氨基酸的不完全相同。 等电点要用等电聚焦等方法测定。
第一节 蛋白质的酸碱性质
第二节 蛋白质分子的大小与形状
一、根据化学组成测定最低相对分子质量
假定某种微量成分只有一个,测出其百分含量后,可用比例式算出最低相对分子质量。 若测出两种微量成分的百分含量,分别用比例式算出的最低相对分子质量不相同时,可计算两个最低相对分子质量近似的最小公倍数。
例题:一种纯酶含亮氨酸(Mr 131)1.65%,含异亮氨酸(Mr131)2.48%,求最低相对分子质量。
解:按照Leu的百分含量计算,最低Mr X1: X1=(100′ 131)/1.65=7939.4。
按照Ile的百分含量计算最低Mr X2: X2=(100′ 131)/2.48=5282.3。
由于X1和X2数字差异较大,提示这种酶含Leu和Ile不止1个,为了估算Leu和Ile的个数,首先计算:
X1/X2=7939.4/5282.3≈1.5。
这种酶含任何氨基酸的个数均应是整数,说明该酶至少含有2个Leu,3个Ile,其最低相对分子质量为:
7939.4 ′2 =15878.8或5282.3×3=15846.9。
二、渗透压法测定相对分子质量
三、沉降分析法测定相对分子质量
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基本原理:
(一)离心力(centrifugal force,Fc)
当一个粒子(生物大分子或细胞器)在高速旋转下受到离心力作用时,此离心力“Fc”由下式定义:
F=m·a=m·ω2 r
a—粒子旋转的加速度,m—沉降粒子的有效质量,ω—粒子旋转的角速度,r—粒子的旋转半径(cm)。
(二)相对离心力(relative centrifugal force,RCF)
由于各种离心机转子的半径或者离心管至旋转轴中心的距离不同,离心力而受变化,因此在文献中常用“相对离心力”或“数字×g”表示离心力,只要RCF值不变,一个样品可以在不同的离心机上获得相同的结果。
RCF就是实际离心场转化为重力加速度的倍数。
F离心力m?2X?2X(2?n/60)RCF?????XF重力mgg980 ?1.118?10?5?n?X。
X为离心转子的半径距离,以cm为单位;g为地球重力加速度(980cm/sec2);n为转子每分钟的转数(revolutions per minute,简写成r/min,或rpm)。
(三)沉降系数(sedimentation coefficient,s)
根据1924年Svedberg对沉降系数下的定义,颗粒在单位离心力场中粒子移动的速度。