生物化学:代谢部分
每克样品含氮克数×6.25×100=100g样品中蛋白质含量(g%) Gly甘氨酸(G) Gln谷氨酰胺(Q) Glu谷氨酸(E) Ala丙氨酸(A) Arg精氨酸(R) Asn天冬酰胺(N) Asp天冬氨酸(D) Lys赖氨酸(K) Leu亮氨酸(L) Ile异亮氨酸(I)
Ser丝氨酸(S) Thr苏氨酸(T) Trp色氨酸(W) Tyr酪氨酸(Y) Cys半胱氨酸(C) Met蛋氨酸(M) Phe苯丙氨酸(F) Pro脯氨酸(P) His组氨酸(H) Val缬氨酸(V)
含共轭双键:色氨酸、酪氨酸。紫外吸收:280nm附近为最大峰。 蛋白质二级结构:α—螺旋、β—折叠、β—转角、无规卷曲。 模体是具有特殊功能的超二级结构,如锌指。
蛋白质三级结构:结构域、分子伴侣、次级键(疏水键、盐键、氢键、Van der Waals力等)。
蛋白质四级结构中,各亚基间的结合力主要是氢键和离子键。 一分子Hb共结合4分子氧。Hb各亚基与O2结合呈正协同效应。 大于10个氨基酸的肽称多肽。
参与肽键形成的6个原子在同一平面上。
B型DNA:右手螺旋,螺旋直径2.37nm,每一螺旋的碱基对数目10.4,
螺距3.54nm,相邻碱基对之间的垂直间距0.34nm,反式糖苷键构象,相邻碱基对之间的转角36°,使构象稳定的相对环境湿度92%,碱基对平面法线与主轴的夹角1°,大沟宽深,小沟窄深。 Z型DNA左手螺旋。
在所有RNA中,mRNA的寿命最短。
hnRNA(不均一核RNA)经剪接成为成熟的mRNA。
大部分真核细胞mRNA的起始结构为5′—末端7—甲基鸟嘌呤—三磷酸核苷(m7GpppN),即帽结构。 真核生物mRNA的3′—末端有多聚A尾。 tRNA含多种稀有碱基。 tRNA二级结构似三叶草。 tRNA三级结构倒L形。
所有tRNA的3′—末端CCA以结束,氨基酸可通过酯键连接在A上。
核酶:催化特定RNA降解。
DNA紫外吸收值:最大在260nm附近(嘌呤和嘧啶都含有共轭双键)。 Tm(DNA解链温度):50%DNA双链打开。GC含量越高,Tm值越高(G≡C)。
DNA变性:双链解离为单链。
snmRNA(非mRNA小RNA)参与基因表达的调控。 单纯酶 结合酶(全酶=酶蛋白+辅助因子(金属或辅酶))
辅基:与酶蛋白共价结合的辅酶。 同工酶催化相同化学反应。 竞争性抑制 非竞争性抑制 反竞争性抑制 Vmax 不变 降低 降低 表观Km 增大 不变 降低 酶分六大类:氧化还原酶类、转移酶类、水解酶类、裂解酶类、异构酶类、合成酶类。 名称 辅酶A(CoA) 磷酸吡哆醛(胺) TPP(焦磷酸硫胺素) FMN(黄素单核苷酸) FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸) NAD+(辅酶Ⅰ,尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸) NADP+(辅酶Ⅱ) 钴胺素辅酶类 四氢叶酸 生物素 米氏方程V?Vmax?S? Km??S?辅酶或辅基 泛酸 Vit B6 Vit B1(硫胺素) Vit B2(核黄素) 尼克酰胺(VitPP之一) Vit B12 叶酸 生物素 Na+依赖型葡萄糖转运体(SGLT)主要存在于小肠黏膜和肾小管上皮
细胞。
血中葡萄糖进入细胞依赖一类葡萄糖转运体GLUT,已发现5种,GLUT—1主要存在于脑、肌、脂肪等组织中,GLUT—2主要存在于肝和胰的β细胞中,而GLUT—4主要存在于脂肪和肌组织中。 酶活性中心→作为质子的供体(酸)→一般酸碱催化作用。 有的基团 →提供电子 →亲核催化作用。 糖无氧氧化反应过程分为糖酵解途径和乳酸生成两阶段。 由葡萄糖分解成丙酮酸,称糖酵解途径。
葡萄糖经己糖激酶磷酸化为6—磷酸葡萄糖,哺乳类动物体内已发现4种己糖激酶同工酶,肝细胞中存在的是Ⅳ型,称葡萄糖激酶,对葡萄糖亲和力很低。
糖酵解途径中有3个非平衡反应:己糖激酶(葡萄糖激酶)、6—磷酸果糖激酶—1和丙酮酸激酶催化的反应。
6-磷酸果糖激酶-1对调节糖酵解途径的流量最重要,ATP和柠檬酸是此酶的变构抑制剂,变构激活剂有:AMP、ADP、1,6—二磷酸果糖和2,6—二磷酸果糖(F—2,6—BP)(最强)。
己糖激酶受其反应产物6—磷酸葡萄糖的反馈抑制,葡萄糖激酶分子内不存在6—磷酸葡萄糖的变构部位,故不受6—磷酸葡萄糖的影响。 糖有氧氧化的反应过程包括糖酵解途径、丙酮酸氧化脱羧、三羧酸循环及氧化磷酸化。
丙酮酸进入线粒体氧化脱羧生成乙酰CoA,此反应由丙酮酸脱氢酶复合体催化,参与的辅酶有硫胺素焦磷酸酯(TPP)、硫辛酸、FAD、
NAD+及CoA。
在真核细胞中,丙酮酸脱氢酶复合体存在于线粒体中,是由丙酮酸脱氢酶(E1),二氢硫辛酰胺转乙酰酶(E2)和二氢硫辛酰胺脱氢酶(E3)三种酶按一定比例组合成多酶复合体,其组合比例随生物体不同而异。
8种营养必须氨基酸:亮、异亮、苏、缬、赖、甲硫、苯丙、色氨酸。 三羧酸循环(TCA循环,柠檬酸循环,Krebs循环):首先由乙酰CoA(主要来自于三大营养物质的分解代谢)与草酰乙酸缩合生成含3个羧基的柠檬酸,再经4次脱氢、2次脱羧,生成4分子还原当量和2分子CO2,重新生成草酰乙酸的循环反应。
TCA循环本身每循环一次只能以底物水平磷酸化生成1个GTP。 TCA循环中有3步不可逆反应(3个关键酶):柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶和α—酮戊二酸脱氢酶催化的反应。
TCA循环是3大营养素的最终代谢通路,是糖、脂肪、氨基酸代谢联系的枢纽。
1分子乙酰CoA经三羧酸循环彻底氧化分解共生成10个ATP。 TCA循环:(乙酰CoA+草酰乙酸)→柠檬酸→顺乌头酸→异柠檬酸→α—酮戊二酸→琥珀酰辅酶A→琥珀酸→延胡索酸→苹果酸→草酰乙酸
磷酸戊糖途径生成NADPH和磷酸戊糖(胞质中进行)。
糖酵解:葡萄糖→6-磷酸葡萄糖→6-磷酸果糖→1,6-双磷酸果糖→→3-磷酸甘油醛→1,3-二磷酸甘油酸→3-磷酸甘油酸→2-磷酸甘油酸→