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甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nifH基因的克隆与序列分析

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甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nifH基因

的克隆与序列分析

作者:张琨琨;牛俊奇;魏春燕;邢永秀;杨丽涛;李杨瑞; 作者机构:;;;;;; 来源:南方农业学报 年:2014 卷:045 期:010

页码:P.1719-1725 页数:7

中图分类:S566.1 正文语种:CHI

关键词:甘蔗;内生固氮菌;变栖克雷伯氏菌;nifH基因;克隆

摘要:【目的】了解甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)DX120E nif H基因的生物信息学,为揭示甘蔗内生固氮菌DX120E的固氮分子机理提供理论依据。【方法】根据NCBI上其他固氮菌株的nif H序列设计引物,对内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E菌进行PCR扩增;运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析,并对其蛋白结构进行预测。【结果】甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nif H基因的ORF为882bp,Gen Bank登录号为KF732646.1,与Klebsiella pneumoniae 342、Klebsiella variicola At-22等6种固氮菌的nif H基因氨基酸序列同源性高达95.0%-99.0%。DX120E nifH蛋白与Klebsiella pneumoniae 342的亲缘关系最近,与非克雷伯氏菌固氮菌的亲缘关系较远。生物信息学分析显示,菌株DX120E的nif H基因编码293个氨基酸,起特别重要的氨基酸残基非常保守。该基因在N端有11个氨基酸残基即酪氨酸—甘氨酸—赖氨酸—甘氨酸—甘氨酸—异亮氨酸—甘氨酸—赖氨酸—丝氨酸—苏氨酸—苏氨酸,其属于典型结合

甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nifH基因的克隆与序列分析

甘蔗内生固氮菌KlebsiellavariicolaDX120EnifH基因的克隆与序列分析作者:张琨琨;牛俊奇;魏春燕;邢永秀;杨丽涛;李杨瑞;作者机构:;;;;;;来源:南方农业学报年:2014卷:045期:010页码:P.1719-1725页数:7中图分类:S566.1正文语种:CHI<
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