技术简介
基于酵母单杂交技术建立了一种以转录因子为中心鉴定其识别作用元件的技术,命名为TF- centered YIH。该技术能够准确、快速简捷、高效的鉴定出转录因子识别的元件,在蛋白质与DNA元件的互作研究中有着广阔的应用前景。
技术原理
在该系统中,瑞源生物研发团队突破了科研困境,引入序列随机化的方法进行了随机 DNA 文库的构建,该文库包含有3×4? 种序列,然后再利用酵母单杂交技术筛选文库鉴定转录因子特异性结合的 DNA 序列。研究的转录因子作为 Bait,随机的短的 DNA 序列文库克隆到 pHIS2 载体中作为 Prey,一个元件序列足够与 TF 结合 。
Prey library
Bait
技术优势
1、可全面了解转录因子识别元件。
2、可快速地鉴定一个特定转录因子结合的各种顺式作用元件。
3、拓展了酵母单杂交的应用范围,使其既可以用于gene-centered研究,也可以用于TF-centered 研究。
4、TF-Centered Y1H可以用于识别转录因子结合的各种元件,且其假阳性率要远远小于Gene-centered Y1H。
5、该方法可以发现大量新的顺式作用元件,方法简单,快速有效。
应用前景
1、可以与ChIP-seq相结合,揭示元件的调控作用。
2、在无ChIP-seq结果的情况下,TF-Centered Y1H鉴定的元件可以根据qRT-PCR或RNA-seq获得的下游靶基因,进行这些基因启动子元件的扫描。 3、利用该文库进行Gene-centered Y1H,将显著减少假阳性。
南京瑞源生物技术有限公司坐落于南京市栖霞区生命科技园,专注于基因组
高通量研究领域,致力于生物高科技研发,目前产品的技术水平已达到省级实验水平,瑞源生物立足于生命科学,为基础研究领域科学工作者提供生物学技术服务,自2019年创立以来,全体员工致力于利用酵母系统研发新药物靶点,专注于生物学研究,长期与全国各大农林/医药院校在大型科研技术研发上紧密合作。
TF-centered Y1H技术
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