PKS-NRPS数据库介绍
陈苏;陈姜;吴祺豪;王鸿
【期刊名称】《中国药学杂志》 【年(卷),期】2016(051)015
【摘要】聚酮类化合物(polyketide,PK)和非核糖多肽(nonribosonmal peptide,NRP)是两大类重要的微生物次级代谢产物,其生物合成需要聚酮合成酶(polyketide synthases,PKSs)和非核糖体多肽合成酶(non-ribosomal peptide synthetases,NRPSs).随着测序技术和生物信息分析手段的快速发展,PKS/NRPS基因簇及其合成产物的信息飞速增长.整合资源,创建PKS/NRPS数据库,以方便科学家进行序列分析,产物结构预测,以及实现分子改造合成新型化合物等的研究.笔者主要介绍近5年开发的与PKS/NRPS相关的重要的数据库,包括PKMiner,NRPSsp,NaPDoS,ClusterMine360和IMG-ABC,为相关领域的研究人员提供参考. 【总页数】4页(1349-1352)
【关键词】聚酮合成酶;非核糖体多肽合成酶;数据库;序列分析;结构预测 【作者】陈苏;陈姜;吴祺豪;王鸿
【作者单位】浙江工业大学药学院,杭州310000;浙江工业大学药学院,杭州310000;浙江工业大学药学院,杭州310000;浙江工业大学药学院,杭州310000 【正文语种】中文 【中图分类】R956 【相关文献】
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PKS-NRPS数据库介绍陈苏;陈姜;吴祺豪;王鸿【期刊名称】《中国药学杂志》【年(卷),期】2016(051)015【摘要】聚酮类化合物(polyketide,PK)和非核糖多肽(nonribosonmalpeptide,NRP)是两大类重要的微生物次级代谢产物,其生物合成需要聚酮合成酶(polyketidesynthas
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