HIV-1中国流行株的生物学表型与V3环序列变异相关性初步研究

HIV-1中国流行株的生物学表型与V3环序列变异相关性

初步研究

黑发欣;洪坤学;宋艳辉;唐海丽;彭虹;徐建青;邢辉;邵一鸣

【期刊名称】《中华医学杂志》 【年(卷),期】2004(084)023

【摘要】目的分析我国HIV-1流行株的生物学表型及其与V3环序列变异的相关性.方法采用传统的共培养方法从HIV-1感染者新鲜外周血单个核细胞(PBMC)中分离病毒并在MT-2 细胞上测定分离株的融合诱导性,用表达CD4 和趋化因子受体CCR5或CXCR4的GHOST(3)测定毒株的辅助受体利用情况,用巢式-聚合酶链反应(nest-PCR)扩增V3环及两侧区序列并对其序列进行测定,用GCG软件分析氨基酸序列.结果在所分析的5个原代毒株中,LTG0213和LTG0214为合胞体诱导型(SI),利用CXCR4辅助受体;XJN0021、XJN0091和SHXDC0041为非合胞体诱导型(NSI),利用CCR5辅助受体.X4/SI病毒和R5/NSI病毒在V3环氨基酸序列方面,存在明显的区别.CCR5表型中国株第8、11、18及第25位氨基酸的共同基序为:8-TXXS/GXXXXXXR/QXXXXXXE/D-25,CXCR4表型株在这些位置出现碱性氨基酸取代(第25位除外),引进正电荷.结论 HIV-1中国流行株的生物学表型与V3环序列变异密切相关,V3环上第8、11、18及第25位积累碱性氨基酸(或由酸性氨基酸转变为中性氨基酸),可以使病毒由NSI/R5表型转变为SI/X4表型,可以根据V3环氨基酸序列预测病毒的生物学表型.

【总页数】5页(1968-1972)

【关键词】HIV-1;表型;HIV包膜蛋白GP120;原代分离株