应用SELDI-TOF-MS技术对患脂肪肝奶牛血浆差异蛋白的
分离鉴定及生物信息学特征
徐闯;朱奎玲;陈媛媛;杨威;夏成;张洪友;吴凌;舒适;沈泰钰
【期刊名称】《中国农业科学》 【年(卷),期】2016(049)008
【摘要】[目的]脂肪肝是围产期奶牛主要代谢性疾病之一,50％产后奶牛受其影响.产后奶牛生产力降低、繁殖性能低下、免疫功能减弱、肝功能衰竭和过早死亡都与脂肪肝有关.表面增强激光解析/电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)是一种对生物样本蛋白质研究的新型高敏感性蛋白质组学方法,文章旨在探讨脂肪肝奶牛血浆蛋白质组学特征.[方法]于黑龙江某集约化养牛场选择产后7-28d,1-2胎次荷斯坦奶牛40头.清晨空腹尾静脉采血10mL,应用肝素抗凝(150U)迅速离心(3 000 r/min,5 min)分离血浆,置于-80℃冰箱冷冻保存.依据血浆甘油三酯(TG＞0.20 mmol·L-1),血浆β-羟丁酸(BHBA＞ 1.2mmol·L-1)浓度和临床症状,将其分为试验组(T)20头和健康对照组(C)20头.应用SELDI-TOF-MS技术测得血浆蛋白质谱,利用Ciphergen Protein Chip Software (Version 3.1.1)对在试验组和对照组所有样品中得到的峰图进行分析,得到原始数据.将两组之间的数据峰值做wilcoxon sum rank test统计检验,用计算出的P值判断峰在两组中是否有显著差异.以0.01作为P值的阈值,筛选出P值小于0.01的差异峰.在得到的差异峰中,将差异峰的m/z值与Swissport蛋白数据库中多肽的理论荷质比(mass to charge ratio,m/z)进行比较,找到最相似的蛋白作为差异峰可能检测蛋白的预测结果.[结果]与对照组相比,试验组奶牛血浆蛋白质谱存在39个差异峰,在得到的39个差异峰中,将差异峰的m/z值与Swissport蛋白数据库中多
应用SELDI-TOF-MS技术对患脂肪肝奶牛血浆差异蛋白的分离鉴定及生物信
