怎样做一张理想的琼脂糖凝胶电泳图
说起跑电泳，肯定有人嗤之以鼻：哎呀！这个跑电泳还不简单啊，做块胶，上个样，插上电源跑就是了。接下来将会向大家展示实验室这些年跑电泳所遇到的一些问题，并为大家分析不同电泳图的所代表的结果以及在如何解决这些问题，希望对大家做出理想（漂亮）的电泳图有所帮助。
一、做一块优质的琼脂糖凝胶
正所谓“工欲善其事，必先利其器”，能否做一块好的琼脂糖凝胶，直接影响到后面的电泳和结果的分析。新手一开始跑电泳的时候，会出现各种各样奇怪的图，如下图。
图一 图二
从图一上看，DNA电泳时，DNA条带好像遇到阻碍而发生了扭曲；图二中DNA亮带虽没有发生扭曲，但是却出现了杂斑亮带。这是因为在制胶时带入了其它杂质，形成了障碍物，使得DNA条带电泳时受到阻碍无法继续电泳，从而形成扭曲带
（如图一）；或者是制胶时溶胶不完全以致琼脂糖颗粒残留，形成一些浓度较高的凝胶区域，在DNA电泳经过这些区域时，部分DNA被阻碍在这里而形成不规则亮带（如图二）。
所以建议在制胶时注意以下几点：
在制胶时必须将制胶模具、梳子以及烧杯等物品洗净，以免干胶及其他杂质带入；
在溶胶时应观察溶液中是否有未溶解的琼脂糖颗粒，确保溶胶完全；
在溶液倒入制胶模具前必须充分混匀，以免制出来的胶出现不均匀的现象。
二、选择合适浓度的琼脂糖凝胶
除了以上这种低级问题，还有一个容易忽略的问题，那就是凝胶的浓度。比如：
1：50bp DNA Ladder
（simgen，cat.No.MD1001）
2：100bp DNA Ladder
（simgen，cat.No.MD1002）
3：500bp DNA Ladder
（simgen，cat.No.MD1003）
4：1kb DNA Ladder
（simgen，cat.No.MD1004）
5：λHinding Ⅲ
1 2 3 4 5
1 2 3 4 5
图三 图四
以上这两幅图是用相同的DNA Ladder、上样量、电泳电压并且跑了一样长的时间时，为啥差别非常明显？哪里不一样呢？就是由于采用了不同浓度的凝胶电泳而导致的。那怎么选择合适浓度的琼脂糖凝胶呢？简而言之，长片段的DNA选用低浓度的凝胶电泳，短片段的DNA则选用高浓度的凝胶电泳--具体参考方案参考下表：
表一：分离不同大小的DNA片段所用的最适凝胶浓度
怎样做一张理想的琼脂糖凝胶电泳图
