中南大学《临床科研实验技能》MOOC-PCR实验操作流程
PCR实验操作流程
PCR实验操作必须在无菌条件下进行,以确保实验的稳定性。
首先我们需清洁实验操作台。用75%酒精擦洗超净工作台,关上超净工作台,关上电灯,紫外灯照射半小时。
书写实验记录,主要记录实验日期、所用试剂和具体用量、PCR条件设定、使用DNA样本(模板)分子号和所用引物名称等。(提前记录好,后续实验步骤可按照实验记录进行)
我们取出PCR所用试剂,有10×Taq Buffer、dNTPs、MgCl2溶液、Taq DNA聚合酶(保存在冰箱或冰盒中,随取随用)、PCR引物、gDNA模板和PCR实验用水。
把PCR所用试剂按说明书实验剂量(以Thermo SCIENTIFIC Taq DNA Polymerase 50 μL反应体系为例)加入200 μL EP管中。
首先加入33.75 μL PCR实验用水(Nuclease-free water),然后分别按量加入5 μL 10×Taq Buffer,3 μL浓度为25 mM MgCl2溶液,5 μL浓度为2 mM dNTP混合液(dNTP Mix),1 μL正向引物和1 μL反向引物(10 μM),1 μL gDNA模板(10 pg~1 μg),最后在冰盒里取出0.25 μL Taq DNA聚合酶(5 U/μL)加入,混匀。 以上步骤可以按一定比例预先配好(例如,当使用不同gDNA模板和引物时,可按比例将PCR实验用水、10×Taq Buffer、MgCl2溶液和dNTP Mix预先配好,再按比例吸取一定量混合液加入对应EP管中,混匀)。
将已按说明书要求加完PCR实验试剂的EP管依次放入PCR扩增仪中。 设置PCR实验条件,如预变性95℃3 min,变性95℃30 s,退火60℃30 s,延伸72℃1 min,变性-退火-延伸35个循环,最后延伸72℃5 min,4℃维持。以上退火温度(Tm-5)和延伸时间(1 min/kb)依据扩增模板等要求进行调整。 待PCR结束后,关闭PCR扩增仪。取出PCR产物准备检测。
中南大学《临床科研实验技能》MOOC 主讲人:邓昊 教授