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PCR法检测HBV
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摘要:目的 了解乙型肝炎病毒的相关知识及PCR技术在乙型肝炎病毒检测方面的应用,
并通过实验的方法加深理解。方法 将已导入乙肝病毒特定段基因的质粒用基因扩增仪进行扩增,然后分两组进行电泳,并设置阴性对照、阳性对照、空白对照和Marker对照组。电泳完毕后将胶板放在UVP凝胶成像系统下观察,对照。结果 实验组1弱阳性, 实验组2阴性。 讨论 分析了实验结果及误差产生的可能原因。
关键词:HBV PCR 琼脂糖凝胶电泳 一、 引言 1.现状
乙型肝炎病毒感染是一个全球性的公共卫生问题。据估计,全世界大约有20亿人是过去或现在的HBV感染者以及超过350万人长期感染乙肝病毒。在受感染的青少年或成人中, 5 % -10 %将发展成慢性携带者,而在受感染的新生儿达90 %慢性化发展。在慢性HBV感染者中, 70 % -80 %可以持续正常多年或终身。进一步持续病毒感染,可以导致慢性活动性肝炎,甚至可能发展至肝硬化和肝癌。[1]在我国,乙肝病毒携带者约有1.2亿人。
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2.HBV 的形态与结构[2]
感染者血清中用电镜观察可见三种不同形态的HBV颗粒,即大球形颗粒、小球形颗粒和管形颗粒。
大球形颗粒亦称Dane颗粒,是具有感染型的完整成熟的HBV,呈球形。病毒外层有7nm厚的包膜,内层为病毒核心(核衣壳)结构,成二十面体立体对称。HBV核心内部含有双股不完全环状的DNA基因组和DNA多聚酶。小球形颗粒,主要为HbsAg,不含HBV DNA和DNA多聚酶,无感染性。管形颗粒,是由小球形颗粒“串联”而成,不含病毒核酸,无传染性。 3.HBV基因结构及抗原组成[3]
HBV-DNA分为负链(长链)及正链(短链),其中负链有4个开放
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阅读框架,分别称为S、C、P和X基因区,他们彼此间相互重叠,以不同的启动子编码多种蛋白。
⑴S基因区: S区基因有3个不同的启动子,分别形成S基因、PreS1基因与PreS2基因,分别编码HbsAg、PreS1Ag和PreS2Ag三种包膜蛋白多肽;
⑵C基因区: 由前C基因和C基因组成,分别编码HBeAg及HBcAg; ⑶P基因区: P区基因最长,编码HBV-DNA多聚酶、反转录酶及RNA酶H(Rnase H)等;
⑷X基因区: X区基因编码的蛋白称为HbxAg,可反式激活HBV 的基因,增强HBV 基因的复制和表达。 4.HBV的检测
近二十年以来,人们在乙肝诊断方法方面做了大量的研究工作。早期阶段主要应用生化检查方法即肝功能检查,还有免疫学方法,主要采用血清学方法检测血清HBV抗原、抗体,检测HBV DNA 多聚酶等。近来随着分子生物学的快速发展,分子生物学技术检测血清HBV DNA( HBV感染的直接标志)的方法开始被应用于乙肝的诊断,并且不断发展完善。
聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、 快速、 简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究的目的基因或某一DNA片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍。将PCR技术和琼脂糖凝胶电泳结合,可用于HBV DNA的检测,
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并且具有以上优点。[4]
二、 实验材料和主要实验仪器
1. 模板:重组质粒(将乙肝病毒特定段基因导入到质粒中) 2. 特异性引物
上游引物:5’-CACCTCCTCCTGCCTCCACCAATC-3’(1299-1322)24 bp 下游引物:5’-GGCCCCCAATACCACATCATCCAT-3’(2133-2157)24bp 3. DdH2O,缓冲液10×buffer+Mg2+,dNTP,Taq
4. 溴酚兰 :BIOER,Lot NO.20071002,storage -20℃ 5. Marker:BIOER,BioDL2000,Lot NO.20071002
6. 电泳仪,生产厂家:北京百晶生物技术有限公司,型号BG-Power600
7. 基因扩增仪,生产厂家:EPPENDOF
8. UVP Bioimaging systems,American UVP corporation,GDS-8000 system
9. 微型漩涡混合器,上海康华仪器制造有限公司,型号WH861 10.微量加样器,生产厂家:北京百晶生物技术有限公司 11.EP管 三、 实验方法 1. PCR
⑴将反应体系各成分加入EP管中,用微型漩涡混合器震荡混匀,各种成分的量见下表:
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