lncRNA在乙脑病毒感染PK15细胞过程中的作用研究
杜程涛，汪 涵，杨松柏，李向臣，周晓龙*，赵阿勇*
【摘 要】本研究旨在初步探索乙脑病毒(JEV)感染PK15细胞后的增殖情况，筛选与病毒感染相关的lncRNA，并对其进行亚细胞定位及靶基因预测。通过免疫荧光试验来检测病毒结构蛋白E的表达情况，采用TCID50法检测PK15细胞中病毒的增殖情况，利用实时荧光定量PCR检测病毒感染后lncRNA的表达水平，在NONCODE数据库对lncRNA进行亚细胞定位，通过starBase、NONCODE、KEGG等数据库对其进行靶基因预测和信号通路分析。结果显示，JEV感染PK15细胞后，24～36 h为病毒滴度指数增长期，感染后36 h病毒滴度已达10-5.75 TCID50/mL。PK15细胞在感染JEV 12 h后，lncRNA A、B、C表达水平均无显著变化(P>0.05)，lncRNA D表达水平极显著下降(P<0.01)；感染JEV 24、36 和48 h后lncRNA A、B、C表达水平极显著上升(P<0.01)，lncRNA D表达水平极显著下降(P<0.01)。lncRNA A主要定位在胞质溶胶，lncRNA B在细胞核和细胞质中均有分布，lncRNA C主要定位在细胞质中，在细胞核中也有可能分布，lncRNA D可能在细胞内呈现广泛性分布。通过靶基因预测和信号通路分析，lncRNA A、B、C的靶基因主要为OAS1、OAS2、OASL、COX1等，lncRNA D的靶基因主要为DST、ND1、ND2、ND4等。信号通路分析发现lncRNA可能通过肿瘤坏死因子(TNF)、NF-κB和Toll样受体(TLR)等信号通路参与病毒感染后的增殖过程。本研究为进一步探索宿主细胞lncRNA对病毒增殖的影响奠定一定的基础。 【期刊名称】中国畜牧兽医 【年(卷),期】2019(046)007
lncRNA在乙脑病毒感染PK15细胞过程中的作用研究
