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DNA重组技术的基本工具

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1.1 DNA重组技术的基本工具

“工欲善其事,必先利其器”。我国拥有自主知识产权的转基因抗虫棉,就是通过精心设计,用“分子工具”构建成的。培育抗虫棉首先要在体外对含有抗虫基因的DNA分子进行“切割”、改造、修饰和“拼接”,然后,导入棉花体细胞内,并使重组DNA在细胞中表达。实现这一精确的操作过程至少需要三种工具,即准确切割DNA的“手术刀”、将DNA片段再连接起来的“缝合针”将体外重组好的DNA导入受体细胞的“运输工具”。科学家已经找到并运用了这三种必需的工具,才使培育抗虫棉这一奇妙构想变成了现实(图1-1)。

图1-1 抗虫棉(左侧为对照)

寻根问底

根据你所掌握的知识,你能推测这类酶存在于原核生物中的作用是什么吗? 限制性核酸内切酶——“分子手术刀”

切割DNA的工具是限制性核酸内切酶(restrictionen donucleases),又称限制酶(restriction enzyme)。这类酶主要是从原核生物中分离纯化出来的。迄今已从近300种不同的微生物中分离出了约4000种限制酶。它们能够识别双链DNA分子的某种特定核苷酸序列,并且使每一条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键(图1-2)断开。大多数限制酶的识别序列由6个核苷酸组成,例如,EcoRI、SmaI限制酶识别的序列均为6个核苷酸,也有少数限制酶的识别序列由4、5或8个核苷酸组成。DNA分子经限制酶切割产生的DNA片段末端通常有两种形式—黏性末端和平末端(图1-3)。当限制酶在它识别序列的中心轴线(图中虚线)两侧将DNA的两条链分别切开时,产生的是黏性末端,而当限制酶在它识别序列的中心轴线处切开时,产生的则是平末端。

生物技术资料卡

限制酶的名字怎么起?

限制酶的名字是怎么起的呢?是用生物属名的头一个字母与种名的头两个字母,组成了3个字母的略语,以此来表示这个酶是从哪个生物中分离出来的。例如,一种限制酶是从大肠杆菌(Escherichia coli)的R型菌株分离来的,就用字母EcoR表示;如果它是从大肠杆菌R菌株中分离出来的第一个限制酶.则进一步表示成EcoRI 。

DNA连接酶——“分子缝合针”

将切下来的DNA片段拼接成新的DNA分子,是靠DNA连接酶来完成的。1967年,世界上几个实验室几乎同时发现了一种能够将两条DNA链连接起来的酶,称之为DNA连接酶(DNA ligase)。根据酶的来源不同,可以将这些酶分为两类:一类是从大肠杆菌中分离得到的,称为E·coli DNA连接酶;另一类是从T4噬菌体中分离出来的,称为T4DNA连接酶。这两类酶都是将双链DNA片段“缝合”起来,恢复被限制酶切开的两个核苷酸之间的磷酸二酯键(图1-4),但这两种酶的作用有所差别:E·coli DNA连接酶只能将双链DNA片段互补的黏性末端之间连接起来,不能将双链DNA片段平末端之间进行连接。而T4DNA连接酶既可以“缝合”双链DNA片段互补的黏性末端,又可以“缝合”双链DNA片段的平末端,但连接平末端之间的效率比较低。

寻根问底

DNA连接酶与DNA聚合酶是一回事吗?为什么? 想一想,具备什么条件才能充当“分子运输车”? 基因进入受体细胞的载体——“分子运输车”

用什么方法才能将外源基因送入细胞中呢?通常是利用质粒(plasmid)作为载体(vector),将基因送入细胞中。质粒是一种裸露的、结构简单、独立于细菌拟核DNA之外,并具有自我复制能力的很小的双链环状DNA分子。质粒DNA分子上有一个至多个限制酶切割位点,供外源DNA片段(基因)插入其中。携带外源DNA片段的质粒进入受体细胞后,在细胞中进行自我复制,或整合到染色体DNA上,随染色体DNA进行同步复制。质粒DNA分子上有特殊的标记基因,如四环素抗性基因、氨苄青霉素抗性基因等标记基因,供重组DNA的鉴定和选择(图1-5)。

在基因工程中使用的载体除质粒外,还有λ噬菌体的衍生物、动植物病毒等。它们来源不同,在大小、

结构、复制以及插入片段大小上也有很大差别。这些基因工程载体的作用,就相当于一种运输工具,因此将它们比喻为“分子运输车”。

在进行基因工程操作中,真正被用作载体的质粒,都是在天然质粒的基础上进行过人工改造的。

模拟制作

目的要求

模拟重组DNA分子的操作过程,说出其基本原理。 材料用具

两种颜色(如绿色和粉红色)的硬纸板,剪刀(代表EcoRⅠ),透明胶条(代表DNA连接酶)。 方法步骤

1. 选两种颜色的等宽硬纸板,如绿色纸板和粉红色纸板。在绿硬纸板上依次等距离写上下列字母(字母

要清晰、工整):

在粉红色硬纸板上依次等距离写上下列字母:

2.用剪刀(代表EcoRI)进行DNA“切割”。先分别从两块硬纸板上的一条DNA上找出G-A-A-T-T-C序列,并选G-A之间作切口进行“切割”然后再从另一条链上互补的碱基之间寻找EcoRI相应的切口剪开。

3.待绿、粉红两色硬纸板上的切割位点全部切开后,将粉红色纸板上的DNA片段,重组到绿色硬纸板的切口处。此时用不干胶(代表DNA连接酶)将切口黏结起来。这样你就完成了一个重组DNA分子的模拟制作。

如果你的操作是正确的,不同颜色的黏性末端能互补配对。如果你制作的黏性末端不能互补配对,说明你的操作有误,应重新做一次。

思考与讨论

请按真实操作过程思考一下:

1.你模拟插入的DNA片段能称得上一个基因吗?

2.如果你操作失误,碱基不能配对,可能是什么原因造成的? 进一步模拟操作

如果你有兴趣,可自制有切割位点的纸板,然后按上述步骤剪切和连接,制成一个新的重组DNA分子。

思考与探究

1.限制酶在DNA的任何部位都能将DNA切开吗?以下是四种不同限制酶切割形成的DNA片段:

你能用DNA连接酶将它们连接起来吗? _______和_______能连接形成_______; _______和_______能连接形成_______; _______和_______能连接形成_______; _______和_______能连接形成_______。

2.联系你已有的知识,想一想,为什么限制酶不剪切细菌本身的DNA? 3.天然的DNA分子可以直接用做基因工程载体吗?为什么? 4.网上查询:DNA连接酶有连接单链DNA的本领吗?

DNA重组技术的基本工具

1.1DNA重组技术的基本工具“工欲善其事,必先利其器”。我国拥有自主知识产权的转基因抗虫棉,就是通过精心设计,用“分子工具”构建成的。培育抗虫棉首先要在体外对含有抗虫基因的DNA分子进行“切割”、改造、修饰和“拼接”,然后,导入棉花体细胞内,并使重组DNA在细胞中表达。实现这一精确的操作过程至少需要三种工具,即准确切割DNA的“手术刀”、将DNA片段再连接起来的“缝合针”将
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