圣才电子书www.100xuexi.com十万种考研考证电子书、题库视频学习平台第3章蛋白质的三维结构3.1复习笔记一、蛋白质三维构象的概述一个蛋白质中或一个蛋白质的任一部分中的原子空间排列称为它的三维结构或构象。1.稳定蛋白质三维结构的作用力稳定蛋白质三维结构的作用力主要是一些非共价键或次级键,包括氢键、范德华力、疏水作用和盐键(离子键),此外共价二硫键(—S-S—)在稳定某些蛋白质的构象方面也起作用。表3-1稳定蛋白质三维结构的作用力2.多肽主链折叠的空间限制(1)酰胺平面由于肽键是一个共振杂化体,共振的后果是肽键具有部分双键性质,不能绕键自由旋转,1/56圣才电子书www.100xuexi.com十万种考研考证电子书、题库视频学习平台因此主链肽基形成刚性平面,这个刚性平面称为酰胺平面。酰胺平面内C=O与N-H呈反式排列,各原子间有固定的键角和键长。(2)α-碳原子的二面角一个蛋白质的构象取决于肽单位绕N-Cα和Cα-C键的旋转,这些键连接着多肽链中的刚性的肽单位,绕N-Cα旋转的二面角称为φ,绕Cα-C键旋转的二面角称为ψ。(3)拉氏构象图拉氏构象图展示了二面角φ和ψ的组合与允许构象(不存在位阻)或不允许构象(存在位阻)间的关系。二、研究蛋白质构象的方法1.蛋白质的空间构象蛋白质的空间构象是指蛋白质多肽链主链在空间上的走向以及所有原子和基团在空间中的排列与分布,包括二级结构、三级结构和四级结构。2.研究蛋白质构象的方法(表3-2)表3-2研究蛋白质构象的方法2/56圣才电子书www.100xuexi.com十万种考研考证电子书、题库视频学习平台三、蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构是指多肽链的主链在空间的排布,或规则的几何走向、旋转及折叠。折叠的结果是疏水基团埋藏在蛋白质分子内部,亲和基团暴露在分子表面。主要的二级结构元件有α螺旋、β折叠片、β转角和无规则卷曲。1.α螺旋和β折叠片α螺旋和β折叠片是蛋白质中最常见、最主要以及含量最丰富的二级结构元件,它们的结构特点如表3-3所示。表3-3α螺旋和β折叠片的结构特点和比较3/56圣才电子书www.100xuexi.com十万种考研考证电子书、题库视频学习平台2.β转角β转角又称β弯曲或称发夹结构,是一种非重复性结构,能在球状蛋白质中观察到一种简单的二级结构元。在β转角中Gly和Pro出现的频率较高。氨基酸的组成决定β转角的特定构象。3.Ω环Ω环是最新发现的一类二级结构,是一种部分规正二级结构,形式上是β转角的延伸。不超过16个氨基酸残基,一般6~8个;可以改变肽链走向,使成环的首位残基距离<1nm。4.无规卷曲无规卷曲又称卷曲,泛指那些不能被归入明确的二级结构如折叠片或螺旋的多肽区段。无规卷曲是明确而稳定的结构,它们受侧链相互作用的影响很大。这类有序的非重复性结构4/56圣才电子书www.100xuexi.com十万种考研考证电子书、题库视频学习平台经常构成酶活性部位和其他蛋白质特异的功能部位。四、纤维状蛋白质纤维状蛋白质广泛地分布于脊椎和无脊椎动物体内,它是动物体的基本支架和外保护成分,它们的分类及特点如表3-4所示。表3-4纤维状蛋白的分类五、超二级结构和结构域1.超二级结构超二级结构是指由若干相邻的二级结构元件组合在一起,彼此相互作用,形成种类不多的、有规则的二级结构组合体,在多种蛋白质中充当三级结构的构件。已知的超二级结构有三种:αα、βαβ和ββ。表3-5超二级结构的三种主要形式5/56
好文档 - 专业文书写作范文服务资料分享网站