南京地区人感染杯状病毒的病原学检测

南京地区人感染杯状病毒的病原学检测

许可;张雪峰;李亮;吴斌;朱凤才

【期刊名称】《中国人兽共患病学报》 【年(卷),期】2008(024)010

【摘要】目的 了解南京地区病毒性腹泻患者中杯状病毒的感染情况,明确该地区杯状病毒的主要基因型和分子进化特点.方法 收集南京市儿童医院疑似病毒性腹泻粪便标本155例,南京市某三甲医院成人腹泻标本8例,采用RT-PCR方法检测粪便中诺如病毒和札如病毒的多聚酶区核酸片段,并测序以明确基因型,对核苷酸序列使用CLUSTALW和phylip软件分析病毒的分子进化和亲缘关系.结果 婴幼儿的155例标本共检出15例杯状病毒阳性,检出率达到9.7%,成人检出5份阳性,与婴幼儿感染的诺如病毒核酸在多聚酶区未发现显著差异,均为GⅡ4型,与GENBANK上序列号为EU074213(苏州)、EU096514、EF200699 的毒株有较高的同源性;婴儿腹泻中有一例经核酸序列比对确认为札如病毒感染,为SGⅡ型,与GENBANK上序列号为AF439862的有94%的同源性.结论 杯状病毒是本地区病毒性腹泻的重要病原体,感染的该病毒以诺如病毒GⅡ4型为主,与近年多个地区发现的该病毒有较近的亲缘关系.南京地区存在札如病毒感染. 【总页数】4页(937-940)

【关键词】诺如病毒;札如病毒;基因型;系统发生树 【作者】许可;张雪峰;李亮;吴斌;朱凤才

【作者单位】江苏省疾病预防控制中心,南京,210009;江苏省疾病预防控制中心,南京,210009;江苏省疾病预防控制中心,南京,210009;江苏省疾病预防控制中心,南京,210009;江苏省疾病预防控制中心,南京,210009