生命科学学院生物化学
第二章 蛋白质
第一节 蛋白质的概念及其生物学意义
一、什么是蛋白质?
α—AA 借肽键相连形成的高分子化合物(短杆菌肽含D-苯丙氨酸) [肽键:—C—NH— 也叫酰胺键] 二、蛋白质的生物学作用(或称功能分类)
物质吸收与运输、运动,调节代谢、储存养分、催化各种生化反应、分子间的识别(支架蛋白)、信息传递(受体 复制酶)、记忆、疾病防御 — 抗体。 应用:固体酶的工业应用(联于水不溶性树脂上)、脱(纺织品)浆(淀粉酶)、生化制药,蛋白酶用于皮革的脱毛及软化等,都是利用蛋白质的催化作用,蛋白质生物芯片(贮存信息量大,将多种蛋白质抗体固定、排列到玻璃板上,能检测各种疾病蛋白及其他基因表达蛋白),进行病原体与疾病诊断等。
第二节 蛋白质的组成
一、蛋白质的元素组成:
C(50-55%)、H(6-8)、O(20-30%)、N(15-18)、S(半胱aa)(0-4%) 有的还含有P(酪蛋白)、Fe、Zn、Mo(钼Fe蛋白)、Cu、I,特别是含N量都很接近,平均为16% 。所以,测出含N量 × 6.25(100/16 蛋白质系数)即可推测出蛋白质的含量——凯氏定氮。 二、蛋白质的aa组成
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O
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通常只有20种,除Pro外均为 α—aa ,除甘氨酸外,都有D、L两种异构体(α—碳原子为不对称碳原子)所以有旋光性。投影式如下:
COOH COOH
H2N — C —H R L—α
aa的分类方法: (一)氨基酸的种类
分类一 根据侧链基团R的化学结构分为四类: 第一类 脂肪族aa:侧链是脂肪烃链
①一氨基一羧基(中性):一氨基一羧基aa中共九种:
H — CH — COOH CH2 — CH — COO- — COO-
NH2
OH NH+3 NH+3
(Gly:G) (Ser:S) CH3 — CH — COO- CH3 — CH — CH— COO- 第2页 共132页
H —C —NH2
R D —α CH2 — CH SH (Cys:C)
CH3 — CH — CH
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— COO-
NH+3 OH NH+3 CH3
NH+ 3
(Ala:A) (Thr:T) (Val:V 支链aa)
CH3 — S — CH2 — CH2 — CH — C?O- CH3 — CH — CH2 — CH — ?O?-
aa) (Met :M ) NH+3 (Leu : L 支链 CH3
NH+3
CH3 — CH2 — CH — CH — COO- CH3 NH+3 (Ile:I支链aa)
②一氨基二羧基aa(酸性)及其酰胺
—
OOC — CH2 — CH — COO —OOC — CH2 — CH2 — CH —
—
—
COO
NH+3 NH+3 (Asp:D) (Glu:E)
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O O
H2N — C — CH2 — CH — COO H2N — C — CH2 — CH2 — CH — COO
NH+3 NH+3 (Asn:N) (Gln:Q)
③二氨基一羧基aa(碱性: —NH2>-COOH)
—
H3N+ — CH2(CH2)(CH2)3 — CH — COO H2N — C — NH —3— CH
—
—
— COO—
NH3+ NH2+ NH3+
(Lys:K) (Arg:R)
第二类 芳香族aa(含有苯环的化合物叫做芳香族化合物,有的包括Trp):
— CH2 — CH — COO— HO — — CH2 — CH — COO—
(Phe:F) (丙aa取代) (Tyr:Y)
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NH+3 NH+3
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第三类 杂环aa:
HC C—CH2 —CH —COO—……… — CH2 — CH — COO—…
HN+ NH NH+3 N NH+3
CH
(His:H 咪唑基) (Trp :W 吲哚基 苯并吡咯)
第四类 脯氨酸,也称杂环亚氨基酸:由Glu还原、环化、再还原形成
—COO— 四氢吡咯-2-羧酸
NH2+ (Pro:P)
分类二 按侧链R基团的极性(及在pH7左右时的解离状态)分为: 非极性:甘、丙、缬、亮、异亮、苯丙、蛋、脯、色氨酸。
不带电荷:带OH、SH、酰胺基 极性 带负电荷(酸性aa)
带正电荷:Lys、Arg、His (碱性aa) . His等电点为7.59 此外在蛋白质代谢中还有鸟aa、瓜aa(尿素循环中)、胱aa、羟脯aa、羟赖
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