SectionA
1 三个域：真细菌，古细菌，真核生物 2 组装中的主要作用力：非共价健作用力 SectionB
1 蛋白质纯化的分析方法
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2
正电荷：天冬氨酸 谷氨酸 负电荷：赖氨酸 精氨酸 组氨酸
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极性：天冬酰胺 谷氨酰胺 苏氨酸 丝氨酸 半胱氨酸
非极性：脂肪族 甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸 甲硫氨酸 脯氨酸 芳香族 苯丙氨酸 酪氨酸 色氨酸 Cys 二硫键 Gly 无手性 Pro 亚氨基酸
芳香族氨基酸最大吸收峰280mm
3 蛋白质的一级(决定蛋白折叠及其最后的形状的最重要的因素)：氨基酸脱水缩合形成肽链 N端到C端 共价键
二级：多肽链中空间结构邻近的肽链骨架通过氢键形成的特殊结构。 α转角
β螺旋 氢键为主要作用力
三级： 多肽链中的所有二级结构和其他松散肽链区域（散环结构）通过各种分子间作用力（非共价键为主），弯曲、折叠成具有特定走向的紧密球状构象。 非共价键
四级： 许多蛋白分子由多条多肽链（亚基，subunits ）构成。组成蛋白的各亚基以各种非共价键作用力为主，结合形成的立体空间结构即为四级结构。 非共价键 4 偶极：电子云在极性共价键的两原子间不均匀分布，使共价键两端的原子分别呈现不同的电性
兼性离子：具有正电荷（碱性），又具有负电荷（酸性）的分子 双极性分子：
Section C
1核酸的光学特性：
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增色性：一种化合物随着结构的改变对光的吸收能力增加的现象 减色性：一种化合物随着结构的改变对光的吸收能力减少的现象 Reason: 碱基环暴露在环境中的越多，对紫外的吸收力越强 Absorbance（吸收值）：Nucleotide > ssDNA/RNA > dsDNA 核酸的最大吸收峰260mm(碱基有芳香环) 芳香族氨基酸最大吸收峰280mm A260/A280: 纯的 dsDNA：1.8 纯的 RNA：2.0 纯的 Protein：0.5
2 Tm 值（熔解温度）：热变性时，使得DNA双链解开一半所需要的温度。 Tm=2x(A+T) + 4x(G+C)
Tm值与DNA分子的长度，及GC的含量成正比
Annealing（退火）:热变性的DNA经过缓慢冷却后复性 快速冷却： Stay as ssDNA 缓慢冷却: 复性成dsDNA
3 脱氧核糖核酸与核糖核苷酸得到画法
4 支持双螺旋结构的两个实验：查戈夫规则 X射线晶体衍射 5 双螺旋的内容：
双链之间的关系：DNA分子由两条链组成 双链反向平行 (5’
3’ 方向)
两链的碱基通过氢键互补配对，A:T; G:C。 双链序列反向互补
各基团排列方式：糖-磷酸骨架DNA分子排列在外;
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碱基对平面相互平行，排列在DNA分子的内部。 空间结构为：右手双螺旋结构
每转一圈~10个碱基对，每一圈长度33.2A 双链螺旋中形成大沟，小沟。
6 碱对DNA的影响：高pH值对DNA的影响比低pH值的要小。
高 pH 值(pH>11)会改变碱基构象，使DNA变性（双链解旋，成单链） RNA的影响：高pH值，2’羟基会攻击磷酸二酯键，使其断裂，形成2’，3’-环式磷酸二酯键，从而使RNA分子断裂
7 共价闭合环状DNA (convalently closed circular DNA, cccDNA）。即通过共价键结合形成的封闭环状DNA分子。
8 超螺旋DNA（Supercoil DNA）:松弛型双链DNA进一步旋转后，再形成闭环结构时，就会形成DNA超螺旋结构
L=T+W 判断是否为超螺旋 正负超螺旋
9 拓扑异构酶：暂时断裂DNA分子中一条或两条单链上的磷酸二酯键，改变DNA分子的连接数及拓扑状态。
功能：消除DNA复制和转录等过程产生的超螺旋。
细胞中，Ⅰ型酶与Ⅱ型酶的活性保持一种平衡状态。Ⅱ型酶的“使DNA超螺旋化” 与Ⅰ型酶“使DNA松驰化” 相抗衡，从而使DNA保持适当的超螺旋密度。
10 EB: 嵌入DNA配对碱基之间，使DNA分子在嵌入处局部解旋，增加ccDNA其它部位的正超螺旋
11 Type II RE 二型限制性内切酶:识别位点一般为４～8个碱基对的回文序列 如：EcoRI 5’-GAATTC-3’ 3’-CTTAAG-5 Section D
1 染色体的折叠：串珠结构 ：核心组蛋白:H2A, H2B, H3 and H4.
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分子生物学总结
