实验名称: 姓 名: 学 号: 系 别: 实验日期: 同组同学名单: 细菌总DNA提取、凝胶电泳检测 摘要:本试验通过提取细菌总DNA,并进行凝胶电泳检测,使我们学习到了细菌总DNA提取的原理和方法以及琼脂糖凝胶电泳方法
实验目的:
1. 学习细菌总DNA提取的原理和方法
2. 学习琼脂糖凝胶电泳方法
实验材料:
1. 菌种:E. coli
2. 试剂:TE、溶菌酶溶液(20mg/ml)、10% SDS、蛋白酶K(20mg/ml)、5mol/L NaCl 、酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)、乙醇
3. 仪器:高速台式离心机、紫外检测仪
4. 其他材料:离心管、无菌吸头 、移液器等
实验方法及步骤:
1. 取1.2ml细菌培养液,6000r/min 离心2min,去上清。
2. 加1.5ml溶菌酶溶液,做成悬液。
3. 37℃水浴20 min
4. 加入0.6ml 10%SDS(0.1mol/l Nacl,0.5mol/l Tris,10%SDS,pH=8)反复颠倒混匀10min,10000r/min离心10min,取上清(分两管,每管各0.6ml)
5. 用等体积苯酚:氯仿:异戊醇各抽提1次,混合均匀(颠倒50次),10000r/min 离心10min,吸上清0.4ml。
6. 加入10μl的3mol/l乙酸钠和0.8ml无水乙醇,-20℃沉淀DNA10min,12000r/min 离心10min,去上清。
7. 加入70%乙醇2ml,转动离心管,倒去液体,待乙醇挥发后(20min),用30μl TE溶解
8. 用移液器吸取总DNA 4μl于封口膜上,再加入1μl 的6X载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔
9. 打开电源开关,调节电压至3-5V/cm,可见到溴酚蓝条带由负极向正极移动,电泳约30min-60min
10. 电泳结束后取出凝胶,置EB 溶液中染色5~10min,清水漂洗
11. 将染色后的凝胶置于紫外透射检测仪上,盖上防护观察罩,打开紫外灯,可见到发出荧光的DNA条带
实验结果:
下图中标记“四1”的为我们所提取DNA条带,可见一条清晰条带,呈现一条迁移率很小的整齐条带。前端有大量DNA分子,稍亮。
实验结果分析:
本实验提取到的总DNA通过电泳分析证明DNA含量水平合适,可以用于PCR实验。琼脂糖是一种天然聚合长链状分子,可以形成具有刚性的滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度 。DNA分子在碱性缓冲液中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动。DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与分子筛效应。不同DNA的分子量大小及构型不同,电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带 。
大肠杆菌是革兰氏阴性菌,其细胞壁薄、肽聚糖含量低。经过溶菌酶处理后,肽聚糖的1,4-糖苷键断裂,细胞壁裂开,同时经过NaOH和阴离子去污剂SDS处理,使细胞膜崩解,从而达到菌体的充分的裂解。在有机溶剂(酚、氯仿)存在时,核酸结合蛋白会发生变性,从核酸分子上解离下来,而由于核酸分子携带有大量负电荷,极性较强,当体系分相时会保留在水相中。在实验过程中,由于细菌裂解后受到剪切力或核酸降解酶的作用,染色体DNA容易被切断成为各种大小不同的碎片而与质粒DNA共同存在,因此,采用乙醇沉淀法得到的DNA除含有质粒DNA