绵羊Lpin2基因多态性及其与尾型和屠宰性状的关联分析
焦小丽1,2,景炅婕1,乔利英1,洪中山2,李留安2,田川尧2,康翠翠2,陈明明2,刘文忠1*
【摘 要】试验旨在研究Lpin2基因遗传变异对绵羊尾型和屠宰性状的影响。以两品种脂尾型绵羊广灵大尾羊和小尾寒羊为研究对象,采用DNA直接测序法检测Lpin2基因5′非编码区部分序列的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其与尾型及屠宰性状的关联性。结果发现,Lpin2基因5′非编码区起始密码子上游约1 200 bp的DNA序列中存在3个SNPs,即NC_019480.2:g.-663 dup ATT(SNP1)、g.-388 T>C(SNP2)和g.-330 T>G(SNP3),其中SNP1为三核苷酸ATT重复扩展短串联重复序列(STR)的拷贝数变异(CNV),在广灵大尾羊中的突变频率显著高于小尾寒羊(P<0.05),显著降低了广灵大尾羊的胴体重与屠宰率(P<0.05),对小尾寒羊的屠宰性状无显著影响(P>0.05)。SNP2和SNP3构成单倍型块,形成的单倍型对各性状无显著影响(P>0.05)。试验结果可为绵羊肉质性状的标记辅助选择提供参考依据。 【期刊名称】中国畜牧兽医 【年(卷),期】2017(044)004 【总页数】9
【关键词】绵羊;Lpin2基因;单核苷酸多态性;关联分析
lipin2是哺乳动物脂素(lipins)蛋白家族(lipin1、lipin2和lipin3)的一个成员,由Lpin2基因编码,在脂质代谢中具有Mg2+依赖的磷脂酸磷酸酶(phosphatidate phosphatase, PAP)和转录共激活脂肪形成关键转录因子PPARγ的双重功能[1-2]。lipin2可调节脂质合成过程中两个重要的中间产物磷