秀丽线虫野生株系和缺氧敏感株系的差异蛋白质组学研究

秀丽线虫野生株系和缺氧敏感株系的差异蛋白质组学研究

李华玲;陈文飞;陈欣虹;周晓霞;张成岗;

【期刊名称】《昆明医科大学学报》 【年(卷),期】2012(033)010

【摘要】目的研究秀丽线虫（Caenorhabditis elegans）野生株系N2和缺氧敏感株系（ia04）的差异蛋白质,为进行线虫在缺氧环境下的应答机制研究奠定基础.方法同步化培养2种株系的线虫,培养至L4期时,常规方法提取总蛋白,采用双向电泳分离和串联质谱分析,搜索Swiss-Prot线虫数据库,鉴定蛋白种类并根据基因本体论（gene ontology,GO）进行分析.结果质谱成功鉴定了其中的25个差异显著蛋白（ratio〉2.0,P〈0.05）,其中N2株系检测到的表达量比ia04株系高的主要是热休克蛋白（HSP-70,HSP-60）、GTP结合蛋白（TAG-210）、乙酰辅酶A脱氢酶中链（GN=T）;ia04株系检测到的表达量比N2高的是延伸因子（EFT-3）和铁硫蛋白-1（ISP-1）,在ia04株系中,HSP的含量明显低于N2株系,说明这可能是ia04株系对缺氧敏感的原因之一.根据GO注释结果发现,鉴定到的这些差异蛋白与线虫的DNA合成及生长发育的相关性较大.结论蛋白质组学的方法为线虫缺氧的研究提供了有参考价值的数据,不同株系差异蛋白的发现可促进对缺氧应答机制的了解,且可从蛋白质水平揭示重要表型的基因表达机制.

【总页数】6页(P.4-9)

【关键词】秀丽线虫;缺氧敏感株系（ia04）;蛋白质组学;热休克蛋白 【作者】李华玲;陈文飞;陈欣虹;周晓霞;张成岗; 【作者单位】;;;;;