第四节 二级结构:多肽链折叠的规则方式
一、α螺旋
(一)α螺旋的结构
多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转,形成螺旋结构,螺旋一周,沿轴上升的距离即螺距为0.54nm,含3.6 个氨基酸残基;两个氨基酸之间的距离为0.15nm。
肽链内形成氢键,氢键的取向几乎与轴平行,每一个氨基酸残基的酰胺基团的-NH 基与其后第四个氨基酸残基酰胺基团的-CO 基形成氢键。 蛋白质分子为右手a-螺旋。
(二)α螺旋的偶极矩和帽化
(三)α螺旋的手性
(四)影响α螺旋形成的因素
R 基太小使键角自由度过大,带同种电荷的R 基相互靠近,β碳原子上有分支均不利于形成α螺旋,含脯氨酸的肽段不能形成α螺旋。
(五)其他类型的螺旋
b-折叠有两种类型。一种为平行式,即所有肽链的N-端都在同一边。另一种为反平行式,即相邻两条肽链的方向相反。
二、β折叠片
b-折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列,通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿桩折叠构像。两个氨基酸之间的轴心距为0.35nm;b-折叠结构可以由两条肽链之间形成,也可以在同一肽链的不同部分之间形成。几乎所有肽键都参与链内氢键的交联,氢键与链的长轴接近垂直。
b-折叠有两种类型。一种为平行式,即所有肽链的N-端都在同一边。另一种为反平行式,即相
邻两条肽链的方向相反。反平行式较稳定。
第5章蛋白质的三维结构
第四节二级结构:多肽链折叠的规则方式一、α螺旋(一)α螺旋的结构多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转,形成螺旋结构,螺旋一周,沿轴上升的距离即螺距为0.54nm,含3.6个氨基酸残基;两个氨基酸之间的距离为0.15nm。肽链内形成氢键,氢键的取向几乎与轴平行,每一个氨基酸残基的酰胺基团的-NH基与其后第四个氨
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