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第三章核酸化学

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第一节 核酸概述

第二节 核酸的分子组成 第三节 核酸的分子结构 第四节 核酸的理化性质 第五节 核酸酶(nucleases) 第一节 概 述 核酸(nucleic acid)

以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。 DNA(Deoxyribonucleic acid)脱氧核糖核酸 RNA(Ribonucleic acid) 核糖核酸 一、核酸的发现和研究工作进展

? 1868年 Fridrich Miescher从脓细胞中提取“核素” ? 1944年 Avery等人证实DNA是遗传物质

? 1953年 Watson和Crick发现DNA的双螺旋结构 ? 1968年 Nirenberg发现遗传密码

? 1975年 Temin和Baltimore发现逆转录酶

? 1981年 Gilbert和Sanger建立DNA 测序方法 ? 1985年 Mullis发明PCR 技术

? 1990年 美国启动人类基因组计划(HGP) ? 1994年 中国人类基因组计划启动

? 2001年 美、英等国完成人类基因组计划基本框架 二、核酸的分类及分布、功能

脱氧核糖核酸:90%以上分布于细胞核,其余分布于核外如线粒体,叶绿体,质粒等。

携带遗传信息,决定细胞和个体的基因型(genotype)。

核糖核酸:分布于胞核、胞液。

参与细胞内DNA遗传信息的表达。某些病毒RNA也可作为遗传信息的载体。 第二节 核酸的分子组成 一、元素组成

? 主要元素组成: C、H、O、N、P(9~11%)

与蛋白质比较,核酸一般不含S,而P的含量较为稳定,占9-11%。 二、基本构成单位:核苷酸(nucleotide) 核苷酸由戊糖、磷酸和碱基三部分构成 表 1 两类核酸的基本化学组成 DNA 腺嘌呤(adenine) 鸟嘌呤(guanine) RNA 腺嘌呤(adenine) 鸟嘌呤(guanine) 胞嘧啶(cytosine) 尿嘧啶(uracil) 嘌呤碱 (purine bases) 胞嘧啶(cytosine) 胸腺嘧啶(thymine) 嘧啶碱(pyrimidine bases)

戊糖(pentose) D-2-脱氧(D-2-deoxyribose ) 核糖D-核糖(D-ribose ) 磷酸(phosphoric acid) 酸(acid) 磷酸(phosphoric acid) 糖与碱基之间的C-N键,称为C-N糖苷键。 核糖核苷:AR, GR, UR, CR

脱氧核苷:dAR, dGR, dTR, dCR 核苷和磷酸以磷酸酯键连接 核苷酸的代号

一般以核苷号加“MP”形成 ,如5′—AMP。常见核苷酸多为5′—核苷酸,通常不写出酯化位置(5′略去)。如5′ —AMP写成AMP。

细胞内的其他核苷酸及核苷酸衍生物 多磷酸核苷酸

ADP、ATP、GDP、GTP等。

ATP的重要生理功能: ① 参与能量代谢。

② 各种三磷酸核苷酸参与DNA 、RAN的生物合成(作原料);

③ 参与其它合成。如UTP参加糖转化、合成,CTP参与嘌呤、蛋白质的合成; ④ 作辅酶的结构成分。如NAD+、 NADP+。

NH2NOO-NNNHHOO-OO-PO-PO-PO-OCH2HHOOHOHAMP 三磷酸腺苷 (ATP)ADP ATP

稀有核苷酸:核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类很多,大部分是上述碱基的甲基化产物。

第三节 核酸的分子结构

一、一级结构(primary structure)

一级结构是指核酸分子中核苷酸的排列顺序及连接方式。核苷酸的排列顺序代表了遗传信息。

1、核苷酸的连接方式: 3?, 5?磷酸二酯键 2、核酸的基本结构形式:多核苷酸链

? 末端: 5? 端、 3?端

? 多核苷酸链的方向: 5ˊ端→3ˊ端(由左至右) 3、表示方法:结构式、线条式、文字缩写 二、DNA的空间结构

(一)DNA的二级结构(secondary structure)

生物体DNA是由两条走向相反的双链互相盘绕而成的右旋螺旋式结构,这种双螺旋结构就是DAN的二级结构

1、碱基组成规则(Chargaff规则)

? [A]=[T],[G]=[C];

[A]+[G]=[T]+[C](嘌呤与嘧啶的总数相等)

DNA双螺旋结构的特点:

DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成;右手双螺旋结构;两

条链方向相反,5′端→3′端;3′端→5′端。

双螺旋结构是DNA二级结构的最基本形式。

嘌呤和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。

螺旋横截面的直径约2nm,每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34 nm,每10

个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩为3.4 nm。

维持两条DNA链相互结合的力是链间碱基对形成的氢键。碱基结合具有严格的配对规律:A与T结合,G与C结合,这种配对关系,称为碱基互补。 A=T,G≡C A+G=T+C

螺旋表面形成大沟(major groove)及小沟(minor groove),彼此相间排列。小沟较浅;大沟较深,是蛋白质识别DNA碱基序列的基础。

氢键维持双链横向稳定性,碱基堆积力维持双链纵向稳定性。

表面功能区:小沟较浅;大沟较深,是蛋白质识别DNA碱基序列的基础

DNA双螺旋的稳定性:

? DNA双螺旋结构在生理条件下很稳定。

? 维持这种稳定性的因素包括:两条DNA链之间形成的氢键,碱基堆积力。 ? 双螺旋结构内部形成的疏水区,消除了介质中水分子对碱基之间氢键的影响; ? 介质中的阳离子(如Na+、K+和Mg2+)中和了磷酸基团的负电荷,降低了DNA

链之间的排斥力等。

? 改变介质条件和环境温度,将影响双螺旋的稳定性。

第三章核酸化学

第一节核酸概述第二节核酸的分子组成第三节核酸的分子结构第四节核酸的理化性质第五节核酸酶(nucleases)第一节概述核酸(nucleicacid)以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。DNA(Deoxyribonucleicacid)脱氧核糖核酸
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