交叉引物恒温扩增技术在结核分枝杆菌检测中的应用
毛秀军1,李世明1,葛晓励2,张国强3,孙绍秋3,王惠良4
【摘 要】【摘要】目的 探讨交叉引物扩增技术(CPA)快速检测系统在结核病诊断中的价值。方法 收集唐山市第四医院2015年3~5月206例结核病就诊患者的痰液标本,其中肺结核患者95例(其中痰涂片阳性26例,阴性69例),非结核患者111例,分别采用RT-PCR法实时荧光定量聚合酶链反应法(RT-PCR)检测标本中的结核分枝杆菌,对结果进行统计分析。结果 涂片法、罗氏培养法、EasyNAT? TB-CPA 法检测初诊疑似肺结核患者痰液的灵敏度分别为:27.37%(26/95)、50.53%(48/95)、56.84%(54/95)、51.58%(49/95)。以罗氏培养结果为诊断金标准,EasyNAT? TB-CPA 法灵敏度为89.58%(43/48),特异度94.94%(150/158);RT-PCR法的灵敏度为83.33%(40/48),特异度94.30%(149/158);EasyNAT? TB-CPA与RT-PCR法相比,总体一致性为98.54%(203/206),Kappa指数值为0.92。结论 TB-CPA法在检测痰液标本中具有较高的临床应用价值,且方法简便、快速。 【期刊名称】检验医学与临床 【年(卷),期】2016(013)008 【总页数】3
【关键词】【关键词】结核分枝杆菌; 恒温扩增; 培养法; 交叉引物扩增技术
结核病是由结核分枝杆菌感染引起的慢性传染病,是全球最具威胁的传染病之一。据世界卫生组织统计,我国患结核病人数居世界第2位,是全世界22个结核病流行严重的国家之一[1]。结核病实验室检查是结核病诊断、治疗方案制
定和治疗效果评估的重要依据。目前我国大多数实验室广泛采用细菌学检查方法,包括抗酸杆菌痰涂片镜检和分枝杆菌分离培养[2]。涂片检查简便、易行,但阳性检查率较低[3-4];分离培养法是目前结核病诊断的金标准,具有很高的灵敏度,但至少需要3~8周的时间,但耗时较长,不能满足结核病早期诊断的要求。随着分子生物学的发展,近年来涌现出很多方法用于结核分枝杆菌的快速诊断及鉴定[2]。然而,以基因序列为基础的快速诊断方法虽然快速、敏感,但仪器、设备和试剂比较昂贵。交叉引物扩增技术(CPA)是一种新的核酸恒温扩增技术,也是中国首个具有自主知识产权的核酸扩增技术[5-6]。CPA是将核酸扩增反应的全过程均在同一温度(63±2)℃下进行,不需要像实时荧光定量聚合酶链反应法(RT-PCR)那样经历几十个温度变化的循环过程。CPA方法简单,设备要求低,可通过一次性肉眼判读结果,且保持了核酸扩增快速、高灵敏度的特点,适合在基层医院推广使用。本研究将CPA法与传统痰涂片镜检法、罗氏培养法和RT-PCR法痰标本中结核分枝杆菌的检测进行临床应用评价,以期满足临床诊断的需求。
1 资料与方法
1.1 一般资料 连续收集唐山市第四医院结核病专科门诊2015年3~5月初诊疑似者肺结核患者痰标本。纳入标准:(1)咳嗽咳痰超过2周因呼吸道症状接受检查的初诊可疑结核病患者;(2)同意留取合格的痰标本并进行检测;(3)痰标本量≥2 mL。就诊患者依照肺结核临床诊断流程参考文献[7]。排除标准:(1)随访的结核病患者;(2)不签署知情同意的结核病患者;(3)已经使用抗结核药物治疗大约2周的患者;(4)试验过程中,因技术性因素造成结果缺失者。最终纳入206例患者,年龄16~70岁,平均(35.0±15.6)岁,男86例,女40例。经
临床诊断的结核病患者182例,其他肺部疾病患者24例。
1.2 仪器与试剂 萋-尼染色试剂(抗酸染色液)由本实验室自己配置;罗氏培养基为外购杭州加伟生物技术有限公司;RT-PCR试剂外购自A厂家(生产批号20150112);结核分枝杆菌核酸检测试剂盒(恒温扩增试纸条法)由杭州优思达生物技术有限公司生产(批号20150116);MK-10E干式恒温金属浴为杭州奥盛仪器有限公司生产;PRC仪器为ABI7500荧光PCR仪。EasyNAT? 核酸提取试剂(注射器法)由杭州优思达生物技术有限公司生产(批号20150124)。 1.3 方法
1.3.1 痰涂片和培养 将收集的痰标本进行荧光法涂片镜检,痰标本的收集和涂片镜检按照《痰涂片镜检质量保证手册》进行操作。荧光染色后镜检,剩余标本依照痰液黏稠程度加入2~3倍4% NaOH,每次均设置空白对照[8]。37 ℃温箱培养,每周观察并及时记录结果。培养阳性的菌株采用硝基苯甲酸(PNB)培养基法进行分枝杆菌鉴定。
1.3.2 EasyNAT? TB-CPA法检测 分别检测国家结核病参比实验室提供的结核核酸参考品(S1~S4),结核分枝杆菌浓度(/mL)分别为103、102、10、1[9]。采用杭州优思达生物技术有限公司生产的EasyNAT?核酸提取试剂(注射器法)对结核分枝杆菌进行DNA的提取;按照EasyNAT? TB-CPA操作说明进行操作,15 min后读取结果并记录试验结果[10]。结果判读:若检测T线和质控C线同时出现或检测T线显色时,判读为阳性;若只有质控C线出现时,判定为阴性;若质控线,检测T线都未出现时,结果为无效。查找原因,可能是扩增抑制,导致失败;或试剂盒损坏导致失败。
1.3.3 RT-PCR法检测 按照厂家试剂说明书操作,使用ABI7500进行扩增和