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第03章 人类基因组学

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影来检测与探针杂交结合的染色体DNA同源序列,依据探针放射性颗粒在某条染色体上的显影位置进行基因定位。

13.基因克隆是从基因组中把某一基因用一定方法分离出来,以便进行单一基因精细结构和功能的研究。

14.定位克隆策略是先抓住目的遗传性状(包括疾病)与基因的联系,先进行定位,而后再鉴定分析目的性状决定基因的表达产物及功能。

(四)问答题

1.基因组学是从基因组整体层次上研究各生物种群基因组的结构和功能及相互关系的科学。其研究内容有三个基本方面:

结构基因组学要研究基因组内基因的数量,基因的定位和每个基因编码区和基因间隔区DNA序列结构。绘制基因组遗传图、物理图、序列图和基因图。

功能基因组学要在基因组层次上研究所有基因的表达,调控与功能。及基因表达在不同生命期、不同生理病理条件下和在不同环境因素下的变化。

比较基因组学是比较不同生物种群基因组之间的异同,探讨其含义。人类基因组多样性研究也属此范畴。

当研究涉及不同领域时,又会产生一些学科分支。

2.人类基因组计划(HGP)的科学目标是至2005年全部测定组成人类基因组的DNA序列,从而为阐明人类所有基因的结构和功能,解读人类遗传密码奠定基础。主要工作任务是认识人类基因组的整体结构,即完成基因组的遗传图、物理图和序列图,在此基础上识别鉴定基因组的每一个基因,逐步完成人类的基因图。

3.遗传图是指每条染色体上的遗传标记的相对位置经连锁分析确定后所构成的图谱,遗传标记间的距离用它们之间交换率来衡量,图距单位1厘摩(cM)即为1%的交换率。染色体上不同遗传标记间的距离可以相加。

物理图是将染色体的随机切割DNA片段的实际排列顺序确定后所构成的图。先用限制酶将染色体切成一个个DNA片段,插入YAC或BAC形成克隆,借这些DNA片段中所存在的STS路标,将之连接成重叠克隆群(contig),即可得出覆盖整个基因组的DNA片段排列顺序。

4.常用的基因定位方法:(1)连锁分析以家系分析和重组值计算为依据,确定待

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定位基因与已定位基因之间的相对位置。(2)体细胞杂交法是利用人/鼠融合细胞中人类染色体丢失,仅剩少数乃至一条人类染色体,结合染色体显带技术,再结合细胞生化性状分析实现基因定位。(3)原位杂交是用核酸探针同染色体标本载玻片上原位变性染色体DNA同源顺序杂交结合,显影定位。(4)放射杂种技术是利用整合有人类染色体随机片段的人/鼠融合细胞克隆嵌板,进行基因定位。人类染色体的随机片段是经人为辐射细胞造成的。

人类基因组计划完成后,所提供的基因组图谱储存大量信息资源,计算机序列识别技术的发展,结合上述基因定位实验方法,大大提高了基因定位的速度和精度。

5.基因克隆有以下三种研究策略:(1)功能克隆:是先从目的遗传性状分析其决定基因的可能功能,从与功能相关的蛋白质入手,找出定位和克隆决定基因的方法。(2)定位克隆:是先将目的遗传性状用一定的方法定位在某一染色体区域,从该染色体区域的“邻接克隆群”中筛选目的遗传性状的决定基因,从而获得决定基因克隆。之后,再研究分析决定基因的产物和功能。(3)候选克隆:是已定位和克隆的基因越来越多的背景下,产生的一种新的基因克隆途径。定位候选克隆是在已定位的染色体区域内,将已知基因都作为候选基因,逐一进行转录表分析和突变鉴定。从中筛选出目的遗传性状的决定基因克隆。功能候选克隆是根据目的遗传性状决定基因的可能功能,检索生物信息数据库中相关基因的功能域,将接近功能域的基因都作为候选基因,从中筛选目的性状的决定基因克隆。

(罗佳滨)

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