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分子生物学常用实验技术操作方法

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By 医药观察媛

分子生物学常用实验技术操作方法

目录

一、感受态细菌制备 ......................................................................................... 2 二、质粒转化 ....................................................................................................... 2 三、质粒提取 ....................................................................................................... 2 四、质粒转染 ....................................................................................................... 3 五、siRNA转染 .................................................................................................. 3 六、免疫印迹分析WB ..................................................................................... 3 七、BCA蛋白定量 ............................................................................................ 4 八、细胞总mRNA提取 ................................................................................... 4 九、Real-time quantitative PCR 检测 mRNA 的表达 ............................. 5 十、免疫沉淀 ....................................................................................................... 5 十一、MTT法检测细胞增殖 .......................................................................... 6 十二、细胞克隆实验 ......................................................................................... 6

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一、感受态细菌制备

取冻存Top 10 菌液冰上解冻,无菌吸取50 μl至4 ml LB培养基中,放于摇床200 rpm,37 ℃培养过夜。次日无菌吸取约40 μl菌液重新接种到4 ml LB培养基中,继续孵育1 ~ 2 小时。将菌液分装转移至无菌2 ml离心管中,冰上放置10 ~ 15 分钟,4 ℃,3,000 × g 离心 5 分钟收集菌体。弃去上清,用 1 ml 预冷的 100 mM CaCl2轻轻重悬细菌,冰上放置 30 分钟,4 ℃,3,000 × g 离心 5 分钟收集细菌。弃去上清,加入 100 μl 预冷的 100 mM CaCl2轻重悬细菌,存于 4 ℃,在 12 ~ 24 小时内使用;或加入灭菌的甘油,使其终浓度为 15 %(v/v),保存于- 80 ℃。 二、质粒转化

取 10 μl 上述连接产物与50 μl感受态细菌混合,冰上放置30 分钟,后放入 42 ℃水浴中热激90秒,迅速取出放至冰上冷却 2 分钟,加入 500 μl LB 培养基,摇床 200 rpm,37 ℃培养 1 小时使细菌复苏。6,000 rpm 离心5分钟,弃去上清,用100 μl LB 培养基重悬细菌沉淀,用接种棒将菌液均匀涂抹在含有氨苄青霉素的固体培养基上,在超净台中晾干,放在37 ℃培养箱中过夜培养。第二天可挑取单菌落接种于4 ml LB 培养基中过夜培养,送样测序或加入终浓度为20 %的甘油冻存于- 80 ℃ 三、质粒提取

取- 80 ℃冻存的菌液 50 μl 或挑取培养皿中的单菌落接种于 4 ml 含有青霉素的LB培养基中培养8小时,接着扩增至 50 ml 过夜培养。使用无内毒素质粒中提试剂盒(CWBIO) 提取质粒:收集菌液,> 6,200 × g 离心 3 分钟, 吸尽上清。向菌体沉淀中加500 μl Buffer P1(提前加入 RNase A),悬浮沉淀;再加入 500 μl Buffer P2, 温和地上下颠倒混匀, 室温静置 5 分钟; 再加入 500 μl Buffer E3,立即上下颠倒混匀,出现白色絮状沉淀,静置5分钟。 16,200× g 离心10分钟,吸取上清加入过滤柱(Endo - Remover Column),16,200 × g离心1分钟过滤向滤液中加入 450 μl 异丙醇,上下颠倒混匀。 向收集管的吸附柱(Spin Column DL)中加入

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200 μl Buffer PS,16,200 × g 离心1分钟过滤进行柱平衡。 将上述的滤液转移至平衡好的吸附柱中,16,200 × g 离心 1 分钟,弃掉 废液;再向吸附柱加入 750 μl Buffer PW(提前加入无水乙醇),16,200 × g 离心1 分钟,弃掉废液; 再将吸附柱 16,200 × g 离心 2 分钟,弃掉废液,室温干燥 5分钟。向吸附膜的中间部位加入 50 ~ 100 μl ddH2O,室温静置5分钟,16,200 × g离心2分钟, - 20 ℃保存质粒。 四、质粒转染

转染前将待转染的细胞以 1 ~ 2 × 105每孔的密度种于 6 孔板中培养。24 小时后, 待细胞长至 50 ~ 80 % 时,按照

DNAfectinTM Plus(Abmart) 说明书进行转染:准备无菌的 1.5 ml 离心管, 先加入 2 μg 的质粒, 再加入 200 μl OPTI-MEM培养基, 然后按照 1:2 的比例加 4 μl 的 DNAfectinTM Plus 转染试剂, 轻轻地振荡混匀,静置20分钟,最后将混合物加入 6 孔细胞培养板中继续培养 24 小时或更长。 五、siRNA转染

转染前将待转染的细胞以 1 ~ 2 × 105每孔的密度种于 6 孔板中培养。24 小时后, 待细胞长至 50 % 时, 按LipofectamineTM 2000(Invitrogen, USA) 说明书进行转染: 转染前吸去含 FBS 的 DMEM 培养基, 加入 900 μl OPTI-MEM 培养基。在无菌的 1.5 ml 的离心管中加入 50 μl OPTI-MEM 和 LipofectamineTM 2000 转染试剂, 再将 siRNA 稀释到 50 μl OPTI-MEM 培养基中, 转染试剂与质粒比例为 2:1, 室温放置 5 分钟。 将两个离心管的稀释液混合在一起, 室温放置 20 分钟后, 加入 6 孔细胞培养板共孵 6 ~ 8 小时, 再换成 2 ml 含 10 % FBS DMEM 培养基继续培养 24 小时或更长。 六、免疫印迹分析WB

用 0.2 %胰蛋白酶/ 0.15 % EDTA 消化并收集细胞, 加入适量的细胞裂解液(10 mM HEPES, 2 mM EDTA, 0.1 % CHAPS, 5

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