学号：20137340012
潍 坊 医 学 院
本科生毕业论文（设计）开题报告
题 目：抗菌肽段FK-13与膜相互作用的分子动力学模拟研究
学生姓名 学专
号 业 XXX 20137340012 生物医学工程 13级本科班 生物科学与技术学院 2016.10-2017.0+6
XXX 讲师
年级、班级
院(系) 课题起止时间 指导教师姓名 专业技术职务
2016年 10月15日
说 明
1.本表一式二份，本人及所在院(系)各一份。
2.开题报告的撰写完成，意味着毕业论文（设计）工作已经开始，学生已对整个毕业论文（设计）工作有了周密的思考，是完成毕业论文（设计）关键的环节。在开题报告的撰写中指导教师不可包办代替。
3.无开题报告者不得申请答辩。 4.本表请用黑色笔填写。
一、选题依据（拟开展研究项目的背景、目的及现实意义） 抗菌肽是机体天然免疫系统的重要组成部分，在宿主防御性反应中起着非常重要的作用[1]。它在昆虫、植物、动物及人体内都有广泛的分布，其结构、功能各异，对细菌具有抗菌能力，对真菌、病毒等多种微生物以及寄生虫具有重要的作用。[1]抗菌肽不仅具有较强的杀灭有害的微生物活性的作用，而且在中和内毒素，抑制肿瘤细胞以及抗炎等方面具有重要的功能。[28]天然的生物抗菌肽因具有广谱的抗菌性、较好的热稳定性和水溶性，对高等动物的正常细胞毒害作用小等优点，成为国内外研究的热点领域[2]。其中，能够抗病毒、抗肿瘤、以及免疫调节的人源抗菌肽LL-37是Cathelicidin 家族中唯一能在人体中发现的抗菌肽[3]。 正因为这样，所以为了了解LL-37的毒理学细胞机制以及了解抗菌肽的抗菌原理，我们研究LL-37与细胞膜的互相作用。这具有十分重要的意义。想要了解LL-37与细胞膜的互相作用，实验是一个很重要的方面。可是，在现有的资料中由于实验条件的限制，目前还不能在分子水平上提供抗菌肽LL-37与细胞膜相互作用过程具体的方式方法以及过程。当今世界，为了研究生物大分子及其复合体，分子动力学模拟已经成为一种必不可少的关键工具而且在生物大分子及其相互作用领域取得了一系列显著成果，而且还在快速发展。分子动力学模拟方法可以在四维时空模拟一个分子系统的演变过程，提供构象随着时间变化的各种信息，进而得到模拟体系的结构、动力学和热力学过程，是实验研究的有效补充。[4]所以，我们要想从微观层面研究抗菌肽的抗菌过程，分子动力学模拟可以说是一个很合适的选择。 本论文使用分子动力学模拟的方法，研究了模拟细菌膜和模拟哺乳动物膜与LL-37抗菌肽段FK-13的互相影响方式。选用GROMACS 53A6力场和SPC水模型对系统进行向例分子动力学模拟，研究了相异膜环境下抗菌肽段FK-13的结构特征， 不同膜与抗菌肽段FK-13的互相影响状况以及这些膜作用先后的改变状况。通过分子动力学模拟研究，在原子水平上来更进一步的展现不同膜与抗菌肽段FK-13互相影响的微观架构，增长了对这种影响进程的了解。
抗菌肽段FK-13与膜相互作用的分子动力学模拟研究
