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结构化学
Gaussian 操作与练习综述报告
学 院 化学化工学院 专业班级 应用化学 指导老师 周德璧 姓 名
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感谢下载载2012年1月1日学 号
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Gaussian 操作与练习综述报告
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(中南大学化学化工学院 应化
0903 ……. )
摘要:熟悉和认识Gaussian view和Gaussian 03W的用法和界面功能,使
用gaussian软件构建三方双锥形CdCl5配位化合物模型并进行优化处理,处理并分析数据。
3-关键词:Gaussian view Gaussian 03W CdCl5 优化 分析 一、关于Gaussian
Gaussian是一个功能强大的量子化学综合软件包。其可执行程序可在不同型号的大型计算机,超级计算机,工作站和个人计算机上运行,并相应有不同的版本。Gaussian功能主要有:分子能量和结构、过渡态能量和结构、键和反应能量、分子轨道、多重矩、原子电荷和电势、振动频率、红外和拉曼光谱、核磁性质、极化率和超极化率、热力学性质、反应路径等。Gaussian的计算可以对体系的基态或激发态执行。可以预测周期体系的能量,结构和分子轨道。因此,Gaussian可以作为功能强大的工具,用于研究许多化学领域的课题,例如取代基的影响,化学反应机理,势能曲面和激发能等等。
3-二、计算原理
计算化学有两种方法(分子力学方法和电子结构理论)。它们所能完成的任务类型基本上是一样的。A计算特定分子结构的能量。和能量相关的一些性质也可以通过某些方法来计算。B 完成构型优化,确定全局或局域最小点。构型优化主要取决于能量的梯度-也就是能量对原子坐标的一阶导。构型优化是化学
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计算的基础,任何性质的计算都是在已优化好的分子结构上进行的。一个分子结构对应一个波函,一个波函就可以解出一个能量值,在自然条件下,体系倾向于以能量最低的形式存在(也就是我们常说的最稳定的构型)。所给的分子结构(不管是手绘的还是来自晶体结构的)在转换为高斯输入的文件时,由于画的不准确(如立体的画成平面的等)和具体化学环境的变化(在不选择溶剂时,默认是在气相中优化,这与晶体环境是完全不同的)而存在一些不合理的地方。所以首先要进行优化,才能进行其他类型的性质计算。C 计算由于分子内原子间运动所引发的分子振动频率。频率是能量对原子坐标的二阶导。频率计算还可以确定其他与二阶导有关的性质。不是所有的化学计算方法都能计算频率。
注意:在研究中比较不同计算水平上的结果是没有意义的。详细的关于理论知识的介绍请参考相关量子化学书;黑箱操作是完全可以的,但量子化学知识的欠缺将使我们只能做一些基本的运算,因为无论是软件自身还是对体系的有一定深度的说明都需要一定的理论底子。
三、主要设备和程序
Gaussian view;Gaussian 03W 软件包;PC一台,配置(Inter? CoreTM i3 CPU M 330 @2.13GHz 2.13GHz 硬盘320G 系统 Windows 7 Ultimate Service Pack 1)
四、具体操作实例
熟悉和认识了
合物来实验。
Gaussian
3-CdCl的功能和操作,以构建三方双锥形5配位化
1、打开Gaussian View,在窗口中构建CdCl5配位化合物,构建完毕后,用二面角工具和角度工具对其进行初步调整;
3-感谢下载载
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图1-CdCl5配位化合物
3-2、选择Calculate—Gaussian,在弹出的窗口选择Job Tybe为Opt+Freq,方法为Hartree-Fork,设定基为3-21G,Charge为-3,然后点submit保存并提交运算给Gaussian 03W;
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