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铁皮石斛钙网蛋白基因DoCRT1的分子克隆与表达研究

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铁皮石斛钙网蛋白基因DoCRT1的分子克隆与表达研究

李依民,张 娜,李 欢,黑小斌,高 静,张明英,颜永刚,张 岗*

【摘 要】摘 要:该研究采用RACE克隆铁皮石斛钙网蛋白(calreticulin,CRT)基因DoCRT1,进行生物信息学分析,并借助定量PCR检测基因表达模式,为揭示该基因在铁皮石斛生长发育及逆境生理中的分子作用奠定基础。结果表明:(1)DoCRT1基因(GenBank登录号KT957551)cDNA全长1 672 bp,ORF长1 275 bp,编码一条由424个氨基酸组成的多肽,分子量49.05 kD,等电点4.42,具有CRT蛋白保守的钙网蛋白/钙联接蛋白P结构域(205~320)和类伴刀豆球蛋白凝集素/葡聚糖酶结构域A(20~222)以及多个基序;蛋白N端含有一个信号肽(1~23)和一个跨膜区域(8~24),预测结果显示主要定位于细胞液泡、胞外,与多种植物CRT蛋白一致性很高(80%~87%)。 (2)DoCRT1蛋白与OsCRT1/2、ZmCRT1亲缘关系近,聚在CRT进化树的CRT1/2分支。(3)qRT-PCR检测结果显示,DoCRT1基因转录本在石斛根中表达量较高,为叶中的2.23倍,且茎与叶中表达量无显著差异。 【期刊名称】西北植物学报 【年(卷),期】2017(037)012 【总页数】7

【关键词】关键词:铁皮石斛;钙网蛋白;基因克隆;定量PCR

在细胞钙信号转导过程中,钙调素、钙调磷酸酶B类似蛋白、钙依赖蛋白激酶或钙网蛋白(calreticulin,CRT)等钙结合蛋白感应钙信号进行信号传递,激活下游基因表达,调节细胞代谢[1]。CRT是动植物中普遍存在的一类Ca2+亲和活性极高、序列高度保守的钙结合蛋白[2]。该蛋白一般有N结构域(氨基末端

铁皮石斛钙网蛋白基因DoCRT1的分子克隆与表达研究

铁皮石斛钙网蛋白基因DoCRT1的分子克隆与表达研究李依民,张娜,李欢,黑小斌,高静,张明英,颜永刚,张岗*【摘要】摘要:该研究采用RACE克隆铁皮石斛钙网蛋白(calreticulin,CRT)基因DoCRT1,进行生物信息学分析,并借助定量PCR检测基因表达模式,为揭示该基因在铁皮石斛生长发育及逆境生理中的分子作用
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