双翅目昆虫线粒体基因组结构特点及其测序通用引物的设计和应用

双翅目昆虫线粒体基因组结构特点及其测序通用引物的设

计和应用

张乃心;张玉娟;余果;陈斌

【期刊名称】《昆虫学报》 【年(卷),期】2013(056)004

【摘要】研究双翅目昆虫线粒体基因组的结构特点,并设计其测序的通用引物,为今后双翅目昆虫线粒体基因组的研究提供参考和依据.利用比较基因组学和生物信息学方法,分析了已经完全测序的26个双翅目昆虫线粒体基因组的结构特点、碱基组成和保守区,并据此设计了双翅目昆虫基因组测序的通用引物.结果表明:双翅目昆虫线粒体基因组长14 503 ～19 517 bp,其结构保守,含有37个编码基因,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA编码基因和2个rRNA编码基因,此外还包含一段长度差异很大的非编码区(AT富含区).基因组内基因排列次序稳定,除个别基因外,其余都与黑腹果蝇Drosophila melanogaster基因排列次序一致.基因组的碱基组成不均衡,AT含量在72.59％ ～85.15％之间,碱基使用存在偏向性,偏好使用AC碱基.全基因组的核苷酸和氨基酸序列保守,共鉴定了11个保守区.在保守区内共设计了26对双翅目线粒体基因组测序通用引物,扩增的目标片段都在1 200 bp以内.将该套通用引物用于葱蝇Delia antiqua线粒体全基因组测序,结果证明其高效、合用. 【总页数】10页(398-407)

【关键词】双翅目;葱蝇;线粒体基因组;基因结构;保守区域;通用引物 【作者】张乃心;张玉娟;余果;陈斌

【作者单位】重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所,重庆市动物生物学重点实