（4）嘉陵江流域：规划保护区3个，保护物种7种，分别为南方鲇、鳜、中华倒刺鲃、黄颡鱼、鲇、长吻鮠、中华倒刺鲃，占规划保护区物种总数的21.21%；
（5）涪江流域：规划保护区5个，保护物种5种，分别为重口裂腹鱼、中华倒刺鲃、四川白甲鱼、黄颡鱼、鳜，占规划保护区物种总数的15.15%；
（6）渠江流域：规划保护区4个，保护物种5种，分别为中华鳖、黄颡鱼、中华裂腹鱼、岩原鲤、华鲮，占规划保护区物种总数的15.15%；
（7）黄河四川段：规划保护区1个，保护物种7种，分别为似鮎高原鳅、厚唇裸重唇鱼、扁咽齿鱼、花斑裸鲤、黄河裸裂尻鱼、骨唇黄河鱼、黄河高原鳅，占规划保护区物种总数的21.21%。
（二）按照重点保护水域布局
“十一五”期间，四川省已建水产种质资源保护区21个，覆盖金沙江、沱江、嘉陵江、涪江、渠江及黄河四川段5大流域，保护区长1705.3km，面积239.46平方公里，其中，重点设在渠江、嘉陵江、涪江流域，占水产种质资源保护区面积的88.67%。
2011-2015年，四川省规划新建水产种质资源保护区35个，将重点覆盖嘉陵江、岷江、涪江、沱江及长江四川段，占规划水产种质资源保护区总面积的75.39%。
（1）长江四川段：规划保护区3个，保护区面积25.16平方公里，占规划保护区总面积的6.23%；
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（2）金沙江流域：规划保护区4个，保护区面积76.18平方公里，占规划保护区总面积的18.87%；
（3）岷江流域：规划保护区7个，保护区面积79.50平方公里，占规划保护区总面积的19.70%；
（4）沱江流域：规划保护区5个，保护区面积44.44平方公里，占规划保护区总面积的11.01%；
（5）嘉陵江流域：规划保护区9个，保护区面积112.21平方公里，占规划保护区总面积的27. 80%；
（6）涪江流域：规划保护区4个，保护区面积42.97平方公里，占规划保护区总面积的10.65%；
（7）渠江流域：规划保护区3个，保护区面积23.19平方公里，占规划保护区总面积的5.75%。
2016-2020年，四川省规划新建水产种质资源保护区23个，将重点覆盖涪江、渠江、金沙江、沱江及黄河四川段，占规划水产种质资源保护区总面积的68.57%。
（1）金沙江流域：规划保护区5个，保护区面积59.11平方公里，占规划保护区总面积的19.16%；
（2）岷江流域：规划保护区2个，保护区面积21.95平方公里，占规划保护区总面积的7.12%；
（3）沱江流域：规划保护区3个，保护区面积32.10平方公里，占规划保护区总面积的10.41%；
（4）嘉陵江流域：规划保护区3个，保护区面积75.00平方公里，占规划保护区总面积的24.32%；
（5）涪江流域：规划保护区5个，保护区面积51.15平方
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公里，占规划保护区总面积的16.58%；
（6）渠江流域：规划保护区4个，流域面积22.63平方公里，占拟建保护区总面积的7.34%；
（7）黄河四川段：规划保护区1个，保护区面积46.50平方公里，占规划保护区总面积的15.08%。
五、效益分析
建立水产种质资源保护区符合国家保护发展和合理利用野生动物资源，维护生态平衡的要求，能够加强对水生生物资源的保护管理，促进水生野生动物种质资源不断增殖，达到可持续利用的目地。
（一）社会效益
1、水产种质资源保护区是一项综合性生态系统保护工程，他将促进天然水域水生生物资源保护，改善生态环境、保护物种繁衍生息、增加水生生物资源量、保护生物多样性。
2、水产种质资源保护区建设是一项社会公益事业，是难以直接用经济价值衡量的。以全面保护自然资源和自然环境为目的，建立保护区后的首要任务是要如何保护好生态系统和特有的保护物种。但从长远的、整体的、生态学的眼光来看，保护区所具有的巨大生态效益和社会效益，所留下来的物种资源和遗传资源是全人类的宝贵财富。
3、通过实施宣传规划内容，能提高全社会对自然环境的保护意识，并积极参与其中，这对实现社会经济可持续发展将产生
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深远的影响。同时保护区丰富的水生生物资源和复杂的自然生态环境，是对广大群众和中小学生进行自然科学、生态环境科普教育的理想场所，有利于提高人们对自然环境的保护意识，促进社会主义精神文明建设。
4、规划的水产种质资源保护区内分布的珍稀、特有和主要经济鱼类，不但丰富了水生生物的多样性，而且有很大的科研价值。如有些物种的分布特征可以作为生物地理学、遗传学和系统进化的研究材料；一些物种对特殊生存环境的适应所形成的行为和身体结构特征，又是仿生学研究的基础。保护区内独特的生态环境和宝贵的自然资源，还可以为有关大专院校和科研单位提供科研和教学实习的基础，有利于提高保护区的科研水平、管理水平，扩大保护区的社会影响，发挥科学研究的社会效益。
（二）生态效益
1、全面加强保护区各项基础设施建设，有利于水生生物资源及生态环境的保护，有利于该区域内的生态环境基本趋于稳定，从而使其独特的生态系统完整性得以延续。同时，水产种质资源保护区的建设，可以保持水生生物物种遗传物质；进一步严格管理，强化研究，保护区内的生态系统将可以长期妥善保存；分布在该区域内的独特的鱼类区系也将被保护下来；通过建立健全生物种质资源库，为这些物种的生存繁衍创造有利条件，对拯救珍稀、濒危、土著物种和主要经济物种，保护生物多样性具有极其重要的意义。
2、水产种质资源保护区将促进保护区内自然环境的改善，
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使水生野生动物有良好的生存环境。同时，通过名优苗种的研究开发，将提高良种覆盖率，提高有效水面利用率，将减少养殖业对环境的影响和对天然鱼类的捕捞压力，对改善区域生态环境起到积极的作用。
3、通过对珍稀、特有、经济鱼类的科学研究，可提高我国渔业研究水平，对资源减少鱼类实施人工繁殖和增殖放流，养护渔业资源，提高资源再生能力，对尽快恢复天然渔业资源量，维护生态平衡，具有十分重要的生态意义。
（三）经济效益
水产种质资源保护区以保护、救护、增殖天然水域水生野生生物资源为主，带动救护保护区流域内其他天然物种，逐渐恢复和增加资源量，确保天然种群长久生存延续，造福子孙后代。同时，通过水产种质资源保护区的建设，可逐步开发当地有一定经济价值的名优土著鱼类，适度开发利用部分天然鱼类资源，促进渔业养殖、提高鱼产品质量和效益，延长渔业产业链，确保四川渔业持续健康发展，具有显著的经济效益。
六、保障措施
（一）组织保障
各级渔业主管部门切实加强对水产种质资源保护区规划和实施的领导，认真做好组织协调和服务工作，做到认识到位、领导到位、工作到位。
各级渔业主管部门统一思想，站在保护全省水产种质资源、
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四川省水产种质资源保护区规划
