基于GEO数据库对脑梗死相关差异基因的分析研究

基于GEO数据库对脑梗死相关差异基因的分析研究

杨正飞; 杨小燕; 郭茂娟; 徐彦龙; 姜希娟

【期刊名称】《《吉林中医药》》 【年(卷),期】2024(039)012

【摘要】目的 比较模型组(MCAO组)大鼠与假手术组(Sham组)大鼠脑组织的差异基因,分析差异基因影响的功能通路,为脑梗死的治疗提供可行的研究方向和具体的作用靶点.方法 在GEO数据库下载MCAO组大鼠与Sham组大鼠脑组织中的表达谱芯片,并通过R软件得到差异基因;利用DAVID 6.8分析差异基因的GO功能富集和KEGG通路富集.结果 通过分析得到148差异表达基因,123条GO富集通路,主要涉及药物反应、脂多糖反应、炎症反应、有机环状化合物反应及细胞外基质等生物过程,并与蛋白结合、受体结合、蛋白质同源化活性、整合素结合、蛋白酶结合及趋化因子的活性等分子功能相关;KEGG通路富集分析,得到显著性富集通路23条,涉及TNF信号通路、NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路和HIF-1信号通路等.结论 TNF信号通路与NF-κB信号通路可能是治疗脑梗死的行之有效的干预方向. 【总页数】4页(1638-1641)

【关键词】GEO数据库; 脑梗死; 差异基因; 富集分析; 基因芯片 【作者】杨正飞; 杨小燕; 郭茂娟; 徐彦龙; 姜希娟

【作者单位】天津中医药大学 天津 300193; 宁夏回族自治区人民医院 银川 750004; 甘肃省中医院 兰州 730050 【正文语种】中文 【中图分类】R743