实验二 总RNA的提取和检测
实验目的
1.掌握从动物组织细胞中提取总RNA的方法；
2.熟悉紫外吸收法检测RNA浓度与纯度的原理及测定方法； 3.掌握RNA琼脂糖凝胶电泳方法并分析总RNA的电泳图谱；
实验原理
（一）概述
1. 10-5 μg RNA/细胞含有rRNA 80-85%：28S 18S 5S tRNA, snRNA 10-15% mRNA 1-5%
2. mRNA 3’端存在20-250个多聚腺苷酸(polyA) 结构，可用oligo(dT)亲和层析柱分离mRNA。
3.RNA分离的方法：异硫氰酸胍氯化铯超速离心法，盐酸胍-有机溶剂法，氯化锂-尿素法，蛋白酶K-细胞质RNA提取法、异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法等。 4.目前常用的是Trizol法。 （二）Trizol的主要成分
1.Trizol 是一种新型总RNA 抽提试剂，主要成分是异硫氰酸胍和苯酚。异硫氰酸胍属于解偶剂，是一类强力的蛋白质变性剂，可溶解蛋白质，其主要作用是裂解细胞，使细胞中的蛋白/核酸物质解聚得到释放。
2.酚虽可有效的变性蛋白质，但是它不能完全抑制RNA酶活性，因此Trizol中还加入了8-羟基喹啉、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase。
3.溶解组织细胞的混合物在氯仿作用下溶液分为水相和有机相，RNA在上层水相
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中。
4.取出水相用异丙醇沉淀可回收RNA；用乙醇沉淀中间层可回收DNA。 (三)总RNA的纯度检测原理：
不同波长的单色光通过溶液时其光的能量就会被不同程度的吸收，光能量被吸收的程度和物质的浓度有一定的比例关系。RNA在260nm紫外光波长处有最大的吸收峰。
因此，可以用260nm波长分光测定RNA浓度，OD值为1相当于大约40μg/mL 的单链RNA。用PH=7.6 的TE（tris HCl缓冲液）稀释RNA样品n倍并以TE为空白对照，根据此时读出的OD 260 值即可计算出样品稀释前的浓度: RNA (mg/mL) = 40×OD 260 读数×稀释倍数(n)/1000
实验步骤
（一）样品处理与Trizol用量
1.提取组织RNA时，每50～100mg组织（即0.5×0.5×0.5cm,约合0.1cm3）用1ml Trizol试剂对组织进行裂解；
2.悬浮细胞先离心沉淀，每5-10×106个细胞加1mL Trizol后，反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞。
3.培养贴壁细胞不须消化，可直接用Trizol进行消化、裂解，Trizol体积按10cm2/mL比例加入。(注意：匀浆一定要彻底，是提取高质量RNA的前提；细胞数量与Trizol的比例，细胞的数量不能过多。) （二）操作步骤
1.细胞中加入1 mLTrizol用移液枪反复吹吸直无明显沉淀后，室温放置5min，使其充分裂解。（注意：此时可放入-70℃长期保持）
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2.按200 μL氯仿/mL Trizol加入氯仿，振荡混匀后室温放置2-3min。(注意：此步一定要振荡混匀，使氯仿和Trizol不分层)
3. 4℃12,000g离心5-10min。样品分为三层：底层为黄色（红或绿）有机相，上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中，水相体积约为所用Trizol试剂的60％。
4.吸取上层水相，至另一新的离心管中。一般400-450μL就足够了，千万不要贪多！（注：千万不要吸取中间界面）
5.加入与水相等体积异丙醇后，上下颠倒混匀，4℃放置5 min。 7.4℃12,000g离心10 min，弃上清，离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。 8.加入1 mL 75%乙醇，（在沉淀对面管壁加入，切勿触及沉淀！）盖紧盖子后，温和转离心管1周，充分润洗管壁。 9.4℃12,000g离心5 min，尽量弃上清。
10..室温晾干或真空干燥5 min。（注：RNA样品不要过于干燥，否则很难溶解） 11.加入适量冰冷无RNase的PEPC水（一般10 -20μL），充分震荡混匀，瞬时离心，备用。 （三）检测步骤
1.将提取的RNA，按1：20加入TE进行稀释
2.稀释过后用分光光度仪进行检测，先使用TE行进校对，空白对照，所有样品要先润洗三次之后，再加入50μL样液进行检测
3.可直接显示260nm下的OD值以及，260/280的对比结果
4.再将剩余未稀释的RNA提取液，进行琼脂糖凝胶电泳检测总RNA的完整性 （具体琼脂糖凝胶电泳操作步骤见实验三）
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结果与分析
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总RNA的提取和检测 实验报告
