琼东海域珊瑚共附生放线菌的多样性
周渊[1,2];谢富全[2];牛文涛[2];郑新庆[2];李登峰[1];张改云[2];;;;;;;
【期刊名称】《应用海洋学学报》 【年(卷),期】2018(037)002
【摘要】应用免培养方法与可培养方法相结合的方式对琼东海域6种珊瑚样品中的共附生放线菌进行研究,具体为滨珊瑚（Porite）、扁脑珊瑚（Platygyra）、角蜂巢珊瑚（Favites）、盔形珊瑚（Galaxea）和鹿角珊瑚（Acropora）.免培养方法中,利用放线菌特异性引物对样品总DNA进行16S rRNA基因序列扩增,并将扩增产物进行Miseq高通量测序,测序结果分析表明,6种珊瑚样品中的放线菌序列属于37个分类单元,主要分布在酸微菌目、棒杆菌目、微球菌目、丙酸杆菌目和假诺卡式菌目,其中37.8%的分类单元与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,可能代表着放线菌新的类群.可培养方法中,通过6种培养基分得137株放线菌,分属于放线菌门放线菌纲5个目11个科下的20个属,优势类群为分枝杆菌属（Mycobacterium）、考克氏菌属（Kocuria）和微球菌属（Micrococcus）,其中放线孢菌属（Actinomycetospora）、柠檬球菌属（Citricoccus）和涅斯捷连科氏菌属（Nesterenkonia）是第一次从珊瑚样品中发现;琼东海域珊瑚共附生放线菌多样性丰富,新类型的放线菌资源挖掘潜力比较大.
【总页数】11页(P.218-228)
【关键词】海洋生物学;珊瑚;共附生放线菌;多样性
【作者】周渊[1,2];谢富全[2];牛文涛[2];郑新庆[2];李登峰[1];张改云[2];;;;;;; 【作者单位】[1]宁波大学,浙江宁波315000;[2]国家海洋局第三海洋研究所,福
建厦门361005;;[2]国家海洋局第三海洋研究所,福建厦门361005;;[2]国家海洋局第三海洋研究所,福建厦门361005;;[2]国家海洋局第三海洋研究所,福建厦门361005;;[1]宁波大学,浙江宁波315000;;[2]国家海洋局第三海洋研究所,福建厦门361005; 【正文语种】英文 【中图分类】P735 【相关文献】
1.琼东海域珊瑚共附生放线菌的多样性 [J], 周渊; 谢富全; 牛文涛; 郑新庆; 李登峰; 张改云
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琼东海域珊瑚共附生放线菌的多样性
