表示质荷比（m/z，因为Z接近于1，故实际上m/z多为离子的质量）。纵轴则表示峰的相对强度(RA,相对丰度)。
(2)质荷比: 离子质量(以相对原子量单位计)与它所带电荷(以电子电量为单位计)的比值,写作m/Z。 (3)峰: 质谱图中的离子信号通常称为离子峰或简称峰。
(4)离子丰度: 检测器检测到的离子信号强度。峰越高表示形成的离子越多，也就是说，谱线的强度是与离子的多少成正比的。 (5)基准峰：在质谱图中，指定质荷比范围内强度最大的离子峰称作基峰，其离子峰的峰高作为100%,而以对它的百分比来表示其他离子峰的强度。
(6)总离子流图:在选定的质量范围内，所有离子强度的总和对时间或扫描次数所作的图,也称TIC图.
(7)质量色谱图:指定某一质量(或质荷比)的离子其强度对时间所作的图。利用质量色谱图来确定特征离子，在复杂混合物分析及痕量分析时是LC/MS测定中最有用的方式。当样品浓度很低时LC/MS的TIC上往往看不到峰，此时，根据得到的分子量信息，输入M+1或M+23等数值，观察提取离子的质量色谱图，检验直接进样得到的信息是否在LC/MS上都能反映出来，确定LC条件是否合适，以后进行SRM等其他扫描方式的测定时可作为参考。
1009080706050403020100
2.03.04.0
1009080706050403020100
2.03.04.05.06.0
6. 影响离子丰度的主要因素：
峰的强度反映出该碎片离子的多少，峰强表示该种离子多，峰弱表示该种离子少。
影响离子丰度的主要因素：1.键的相对强度：2.产物离子的稳定性：这是影响产物离子丰度的最重要因素。3．原子或基团相对的空间排列（空间效应）：空间因素影响竞争性的单分子反应途径，也影响产物的稳定性。4. Stevenson 规则：5.最大烷基的丢失等。
7．质谱中离子的类型
质谱中的离子有多种类型，最基本的有： （1）分子离子
指与分子存在简单关系的离子，通过它可以确定分子量。液质中最常见的准分子离子峰是[M+H]+ 或[M-H]-。
在ESI中, 有时会生成质量大于分子量的离子如M+1, M+23, M+39, M+18......称准分子离子,表示为:[M+H]+,[M+Na]+等。
分子离子有时又叫母离子，是一切碎片离子的母离子，即一切碎片离子是通过分子离子再进一步裂解得到的。写质谱裂解反应要从分子离子写起。
（2）碎片离子：
?? 准分子离子经过一级或多级裂解生成的产物离子。
?? 碎片峰的种类、数目及其丰度则与分子结构、仪器类型、分析条件等因素有关,数目多表示该分子较容易断裂,丰度高的碎片峰表示该离子较稳定,也表示分子比较容易断裂生成该离子。
（3）多电荷离子：
指带有2个或更多电荷的离子,常见于蛋白质或多肽等离子.有机质谱中,单电荷离子是绝大多数,只有那些不容易碎裂的基团或分子结构-如共轭体系结构-才会形成多电荷离子。它的存在说明样品是较稳定的。
（4）同位素离子
由元素的重同位素构成的离子称为同位素离子.
各种元素的同位素,基本上按照其在自然界的丰度比出现在质谱中,这对于利用质谱确定化合物及碎片的元素组成有很大方便, 还可利用稳定同位素合成标记化合物,如:氘等标记化合物,再用质谱法检出这些化合物,在质谱图外貌上无变化,只是质量数的位移,从而说明化合物结构,反应历程等。
8.扫描模式的选择 （1）正负离子模式:
一般的商品仪器中,ESI和APCI接口都有正负离子测定模式可供选择。一般不要选择两种模式同时进行。
正、负离子模式建议根据文献选择。 选择的一般原则为：
?? 正离子模式：适合于碱性样品，可用乙酸或甲酸对样品加以酸化。样品中含有仲氨或叔氨时可优先考虑使用正离子模式。 ?? 负离子模式：适合于酸性样品，可用氨水或三乙胺对样品进行碱化。样品中含有较多的强伏电性基团，如含氯、含溴和多个羟基时可尝试使用负离子模式。
（2） 全扫描方式（Q1扫描）
全扫描数据采集可以得到化合物的准分子离子，从而可判断出化合物的分子量，用于鉴别是否有未知物，并确认一些判断不清的化合物，如合成化合物的质量及结构。
（3）母离子扫描
母离子分析可用来鉴定和确认类型已知的化合物，尽管它们的母离子的质量可以不同，但在分裂过程中会生成共同的子离子，这种扫描功能在药物代谢研究中十分重要。 LC-MS中常见的本底离子
?? m/z 50-150, 溶剂离子，[(H2O)nH+ ，n= 3-112] ?? m/z 102, H+乙腈 +乙酸, C4H7NO2H+,102.0549
?? m/z149, 管路中邻苯二甲酸酯的酸酐, C8H4O3H+,149.0233 ?? m/z 288, 2mm 离心管的产生的特征离子
?? m/z 279, 管路中邻苯二甲酸二丁酯 C16H22O4H+, 279.1591 ?? m/z 316, 2mm 离心管的产生的特征离子 ?? m/z 384, 瓶的光稳定剂产生的离子
?? m/z391, 管路中邻苯二甲酸二辛酯, C24H38O4H+, 391.2843 ?? m/z413, 邻苯二甲酸二辛酯+钠, C24H38O4Na+, 413.2668 ?? m/z 538, 乙酸+氧 +铁（喷雾管）, Fe3O(O2CCH3)6, 537.8793
（3）选择离子扫描（SRM模式）
也称为子离子扫描（ MS/MS ），用于结构判断(得到化合物的二级谱图即碎片离子)和选择离子对作多种反应监测（SRM）。通过Q1选择目标物质的母离子，在Q2发生碰撞反应，Q3对目标物质丰度最大的子离子进行扫描。
液质联用(LCMS)原理简析
