第七章 多底物酶反应动力学
多底物酶占所有酶的一半以上。见下表:
表 酶反应按底物数的分类
反应底物数 单底物反应 单向一底物反应 假单底物反应 酶类型 异构酶 裂合酶 水解酶 氧化还原酶 双底物反应 基团转移酶 A + BXX + Y + ATP三底物或多底物反应 连接酶 X + Y + ATP7.1 双底物酶反应机制
7.1.1 顺序机制ordered mechanism
X-Y + AMP + PPi AX + B X-Y + ADP + Pi 6 24 AA-B + H2OAH2 + B酶催化反应式 AB B + C A-OH + BH A + BH2 占总酶数的% 5 12 26 27
此机制有三元复合物生成,大部分脱氢酶属于顺序机制。 7.1.2 Theorell Chance机制
此机制也属顺序机制,只是没有三元复合物生成。如肝醇脱氢酶,A为NAD+,B为乙醇,P为乙醛,Q为NADH。 7.1.3 随机机制random mechanism
许多激酶的催化机制属于此类。 7.1.4 乒乓机制ping pong mechanism
转氨酶、转磷酸酶、转酰基酶属于此机制。 7.2 双底物顺序反应动力学 7.2.1 反应模式
7.2.2 速度方程推导
按快速平衡法,如果k4、k5 << k-1、k-2,则总反应的限速步骤为EAB的生成,故可将反应模式简写成:
KmB?K[EA][B], [EA]?mB?[EAB]
[B][EAB]KiA?KKK[E][A], [E]?iA?[EA], [E]?iAmB?[EAB]
[A][A][B][EA]V?kp[EAB], [E]0?[E]?[EA]?[EAB]
V?VmVm[EAB]? ?KiAKmBKmB[E]?[EA]?[EAB]KiAKmBKmB??1[EAB]?[EAB]?[EAB][A][B][B][A][B][B]kp[EAB][E]0分子分母同乘以[A][B]得
V?KiAKmBVm[A][B]
?KmB[A]?[A][B]KmB?K[EA][B],[EA]?mB?[EAB]
[B][EAB]KiA?KKK[E][A], [E]?iA?[EA], [E]?iAmB?[EAB]
[A][A][B][EA]V?kp[EAB], [E]0?[E]?[EA]?[EAB]
V?VmVm[EAB]? ?KKK[E]?[EA]?[EAB]KiAKmBKiAmB?mB?1[EAB]?mB[EAB]?[EAB][A][B][B][A][B][B]kp[EAB][E]0分子分母同乘以[A][B]得
V?KiAKmBVm[A][B]
?KmB[A]?[A][B]a.当[A]固定,[B]可变时,速度方程可写成: V?Vm[B]KiAKmB?KmB?[B][A]?V?Vm[B],此方程形式与米氏方程相同。
?KiA?KmB??1?[A]???[B]??b.当[B]固定,[A]可变时,速度方程可写成:
V?KiAKmB[B]Vm[A]Vm[A]??KmB[A]KiAKmB?KmB???[A]??[A]?1??[B][B][B]???Vm?[A]KmB1?[B]KiAKmB[B]?[A]KmB1?[B]
V?Vm?[A]KmB1?[B]KiAKmB?[A][B]?KmB,此方程形式也与米氏方程相同。
7.2.3 讨论
a.固定两种反应物中的任一种,都可以使速度方程写成米氏方程的形式;两种反应物浓度都变化时,则不为米氏方程的形式。
b.当[A]固定,[B]可变时,[A]影响表观米氏常数,不影响最大反应速度。 c.当[B]固定,[A]可变时,[B]既影响表观米氏常数,又影响最大反应速度。 7.2.4 作图法求动力学参数 7.2.4.1 [A]固定,[B]可变时 a.双倒数作图
1KmB?VVm?KiA?11??1????[A]?[B]V, ??m1?KiA?KmB??1?[A]????。
此直线的横轴截距=?b.斜率对
1再作图 [A]KmBKiA1K??mBVm[A]Vm斜率=
此直线的横轴截距=?1。 KiAc.横轴截距绝对值的倒数对
1再作图 [A]?KiA?1?KmB?1??KK??KmB mBiA?[A]?[A]??此直线的横轴截距=?1K。 iA7.2.4.2 [B]固定,[A]可变时 a.双倒数作图
1?KiAKmB?1?1?VV?m[B][A]Vm??1?KmB?[B]??? 在不同的[B]下以
11V对[A]作出不同的直线, 这些直线交于第三象限的一点,交点坐标为
?1?[B]??11?KmB??K,?,横轴截距=?iAVm??K。 iAb.纵轴截距对
1[B]再作图 纵轴截距=
1????1?KmB?1Vm[B]????KmBV?1? m[B]Vm此直线的横轴截距=?1K。 mBc.横轴截距的绝对值对[B]再作图
1?[B]|横轴截距|=
KmBK?11iAK?[B]? iAKmBKiA此直线的横轴截距=?KmB。 7.3 Theorell Chance机制动力学 7.3.1 反应模式