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中南民族大学研究生酶学第七章多底物酶反应动力学

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第七章 多底物酶反应动力学

多底物酶占所有酶的一半以上。见下表:

表 酶反应按底物数的分类

反应底物数 单底物反应 单向一底物反应 假单底物反应 酶类型 异构酶 裂合酶 水解酶 氧化还原酶 双底物反应 基团转移酶 A + BXX + Y + ATP三底物或多底物反应 连接酶 X + Y + ATP7.1 双底物酶反应机制

7.1.1 顺序机制ordered mechanism

X-Y + AMP + PPi AX + B X-Y + ADP + Pi 6 24 AA-B + H2OAH2 + B酶催化反应式 AB B + C A-OH + BH A + BH2 占总酶数的% 5 12 26 27

此机制有三元复合物生成,大部分脱氢酶属于顺序机制。 7.1.2 Theorell Chance机制

此机制也属顺序机制,只是没有三元复合物生成。如肝醇脱氢酶,A为NAD+,B为乙醇,P为乙醛,Q为NADH。 7.1.3 随机机制random mechanism

许多激酶的催化机制属于此类。 7.1.4 乒乓机制ping pong mechanism

转氨酶、转磷酸酶、转酰基酶属于此机制。 7.2 双底物顺序反应动力学 7.2.1 反应模式

7.2.2 速度方程推导

按快速平衡法,如果k4、k5 << k-1、k-2,则总反应的限速步骤为EAB的生成,故可将反应模式简写成:

KmB?K[EA][B], [EA]?mB?[EAB]

[B][EAB]KiA?KKK[E][A], [E]?iA?[EA], [E]?iAmB?[EAB]

[A][A][B][EA]V?kp[EAB], [E]0?[E]?[EA]?[EAB]

V?VmVm[EAB]? ?KiAKmBKmB[E]?[EA]?[EAB]KiAKmBKmB??1[EAB]?[EAB]?[EAB][A][B][B][A][B][B]kp[EAB][E]0分子分母同乘以[A][B]得

V?KiAKmBVm[A][B]

?KmB[A]?[A][B]KmB?K[EA][B],[EA]?mB?[EAB]

[B][EAB]KiA?KKK[E][A], [E]?iA?[EA], [E]?iAmB?[EAB]

[A][A][B][EA]V?kp[EAB], [E]0?[E]?[EA]?[EAB]

V?VmVm[EAB]? ?KKK[E]?[EA]?[EAB]KiAKmBKiAmB?mB?1[EAB]?mB[EAB]?[EAB][A][B][B][A][B][B]kp[EAB][E]0分子分母同乘以[A][B]得

V?KiAKmBVm[A][B]

?KmB[A]?[A][B]a.当[A]固定,[B]可变时,速度方程可写成: V?Vm[B]KiAKmB?KmB?[B][A]?V?Vm[B],此方程形式与米氏方程相同。

?KiA?KmB??1?[A]???[B]??b.当[B]固定,[A]可变时,速度方程可写成:

V?KiAKmB[B]Vm[A]Vm[A]??KmB[A]KiAKmB?KmB???[A]??[A]?1??[B][B][B]???Vm?[A]KmB1?[B]KiAKmB[B]?[A]KmB1?[B]

V?Vm?[A]KmB1?[B]KiAKmB?[A][B]?KmB,此方程形式也与米氏方程相同。

7.2.3 讨论

a.固定两种反应物中的任一种,都可以使速度方程写成米氏方程的形式;两种反应物浓度都变化时,则不为米氏方程的形式。

b.当[A]固定,[B]可变时,[A]影响表观米氏常数,不影响最大反应速度。 c.当[B]固定,[A]可变时,[B]既影响表观米氏常数,又影响最大反应速度。 7.2.4 作图法求动力学参数 7.2.4.1 [A]固定,[B]可变时 a.双倒数作图

1KmB?VVm?KiA?11??1????[A]?[B]V, ??m1?KiA?KmB??1?[A]????。

此直线的横轴截距=?b.斜率对

1再作图 [A]KmBKiA1K??mBVm[A]Vm斜率=

此直线的横轴截距=?1。 KiAc.横轴截距绝对值的倒数对

1再作图 [A]?KiA?1?KmB?1??KK??KmB mBiA?[A]?[A]??此直线的横轴截距=?1K。 iA7.2.4.2 [B]固定,[A]可变时 a.双倒数作图

1?KiAKmB?1?1?VV?m[B][A]Vm??1?KmB?[B]??? 在不同的[B]下以

11V对[A]作出不同的直线, 这些直线交于第三象限的一点,交点坐标为

?1?[B]??11?KmB??K,?,横轴截距=?iAVm??K。 iAb.纵轴截距对

1[B]再作图 纵轴截距=

1????1?KmB?1Vm[B]????KmBV?1? m[B]Vm此直线的横轴截距=?1K。 mBc.横轴截距的绝对值对[B]再作图

1?[B]|横轴截距|=

KmBK?11iAK?[B]? iAKmBKiA此直线的横轴截距=?KmB。 7.3 Theorell Chance机制动力学 7.3.1 反应模式

中南民族大学研究生酶学第七章多底物酶反应动力学

第七章多底物酶反应动力学多底物酶占所有酶的一半以上。见下表:表酶反应按底物数的分类反应底物数单底物反应单向一底物反应假单底物反应酶类型异构酶裂合酶水解酶氧化还原酶双底物反应基团转移酶A+BXX+Y+ATP三底物或多底物反应连接酶X+Y+ATP7.1双底物酶反应机制7.1.1
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