生物信息学考试复习

由天下分享时间：2025/1/23 12:59:05 加入收藏我要投稿点赞

——古

A．名词解释

1. 生物信息学：广义是指从事对基因组研究相关的生物信息的获取，加工，储存，分配，分析和解释。狭义是指综合应用信息科学，数学理论，方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据的科学。

2. 基因芯片：将大量已知或未知序列的DNA片段点在固相载体上，通过物理吸附达到固定化（cDNA芯片），也可以在固相表面直接化学合成，得到寡聚核苷酸芯片。再将待研究的样品与芯片杂交，经过计算机扫描和数据处理，进行定性定量的分析。可以反映大量基因在不同组织或同一组织不同发育时期或不同生理条件下的表达调控情况。

3. NCBI：National Center for Biotechnology Information.是隶属于美国国立医学图书馆（NLM）的综合性数据库，提供生物信息学方面的研究和服务。

4. EMBL：European Molecular Biology Laboratory.EBI为其一部分，是综合性数据库，提供生物信息学方面的研究和服务。

5. 简并引物：PCR引物的某一碱基位置有多种可能的多种引物的混合体。

6. 序列比对：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列。

7. BLAST：Basic Local Alignment Search Tool. 是通过比对(alignment)在数据库中寻找和查询序列(query)相似度很高的序列的工具。

8. ORF：Open Reading Frame.由起始密码子开始，到终止密码子结束可以翻译成蛋白质的核酸序列，一个未知的基因，理论上具有6个ORF。

9. 启动子：是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必须的一段DNA序列。原核生物启动子由上游调控元件和核心启动子组成，核心启动子包括-35区（Sextama box）TTGACA，-10区（Pribnow Box）TATAAT，以及+1区。真核生物启动子包括远上游序列和启动子基本元件构成，启动子基本元件包括启动子上游元件（GC岛，CAAT盒），核心启动子（TATA Box，+1区帽子位点）组成。

10. motif：模体，基序，是序列中局部的保守区域，或者是一组序列中共有的一小段序列模式。

11. 分子进化树：通过比较生物大分子序列的差异的数值重建的进化树。

12. 相似性：序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相似DNA碱基或氨基酸残基序列所占的比例。

13. 同源性：两个基因或蛋白质序列具有共同祖先的结论。

14. 非编码RNA：是指没有编码蛋白质功能的所有RNA，它缺乏ORF，常有编码蛋白质的基因反义转录而来。

15. miroRNA：是含有茎环结构的miRNA前体，经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子（21-23 nt）。

16.RNAi：是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA，dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。是一种转录后水平的基因沉默（PTGS）

B．简答题

1.生物信息学研究内容。

答：（1）生物信息的收集、存储、管理和提供。（2）基因组序列信息的提取和分析。（3）功能基因组分析。（4）生物分子设计。（5）药物设计。（6）生物信息分析的技术与方法研究。（7）应用与发展研究。（8）系统生物学研究。

2.生物信息学的应用。

答：（1）人类基因组计划。（2）人类蛋白质组计划。（3）新药开发中的应用。（4）基因芯片。（5）医学应用。