生物信息学课程习题
第一章 绪论
一、填空
1、在 年，美国国会批准启动人类基因组计划，拟用 年时间测定人类全部 条染色体上共 个碱基序列的测定。 2、 是遗传信息的携带者。
3、蛋白质三维结构测定主要方法有 和 。 4、理想的抗生素靶标应为微生物细胞 所必须，在病原体中高度 ，且在人体中 或与人类基因有 。
5、下图例举了一个计算机辅助药物设计的实例，从a图中我们得到了配体上R基团附近的受体上有 和 残基，具有 性，因此可以将R基团设计为 性基团，如图b中所示的 基团，使得抑制活性比改造前提高了近5000倍。
二、名词
HGP（human genome project），EST（expressed sequence tag）, SNP（single nucleotide polymorphism）, 生物信息学（Bioinformatics）， 药物基因组学（Pharmacogenomics），intron，“Junk DNA”，比较基因组学，蛋白质组学，分子进化树（evolutionary tree），基因组，基因组药物
三、简答
1、简述生物信息学在药物研究开发领域的应用可体现在哪些方面？ 2、如何利用基因组信息寻找新的药物作用靶标？
3、如何利用人类基因组信息实现个性化治疗，其基于的原理是什么？ 4、试叙述基因芯片用于疾病诊断的原理，并说明其优缺点。
5、最近甲型流感流行，请设计甲型流感的分子诊断方法，说明其原理。
第二、三章 数据库
一、单选题
1、以下数据库不能用于检索核酸序列的是（ ） A. GenBank B. PDB C. EMBL D.DDBJ
2、蛋白质结构数据常保存为下面哪一种格式为后缀的文件（ ） A. PDB B. txt C. Seq D. mdb
3、下列格式属于FASTA格式的是 （ ）
A. >seq1 B.
二、填空题
1、阅读以下数据格式，写出以下标注的含义：
LOCUS是 ，DEFINITION是 ，
ACCESSION是 ，VERSION是 ，SOURCE是 在论文中使用了NCBI数据库中的该序列，应标注该序列的编号，应填 。
2、阅读以下Prosite中结构基序的示例，说明其中各符号含义：
－ 连字符用来 。
[ ] 每个方括号中的残基代表序列基序中某一特殊位置 的残基。 { } 大括号中的符号代表序列基序中特定位置 的残基。 X 表示 。
(n) 代表某特定残基的 。
3、下面是NCBI中SARS病毒的基因组，请根据以下图说明SARS基因组有 个基因，编码 个蛋白。
4、检索蛋白质序列可使用哪个数据库，试举两例 、 。 5、检索蛋白质结构常使用 数据库。
6、根据以下检索结果说明该蛋白质结构在PDB数据库中的编号为 ，其结构测定方法为 。
三、名词
一级数据库，二级数据库，Genbank，UniGene，PDB，MMDB格式，EMBL，NCBI，结构浏览器，Rasmal，swiss-pdbviewer，Swiss-model，Prints数据库，Prosite数据库，BankIt，Cn3D，PIR数据库，SCOP数据库，CATH数据库
生物信息学课程复习题
