棉花黄萎病抗菌肽25a2的生物信息学分析

棉花黄萎病抗菌肽25a2的生物信息学分析

巩校东;张东东;栾忠奇

【期刊名称】《安徽农业科学》 【年(卷),期】2010(038)018

【摘要】25a2是从解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）中分离出来的一个棉花黄萎病抗菌肽.利用生物信息学工具分析了抗菌肽25a2的氨基酸序列,预测其信号肽、跨膜区、理化特征、结构域、二级结构、三级结构等性质.结果显示,该蛋白属于分泌蛋白,其序列包含位于N端的一个信号肽和位于C端的一个跨膜区.25a2的二级结构以自由卷曲为主,属于混合型蛋白,三级结构为一个致密的球状.以上特征表明该抗菌肽最可能的作用机制是\地毯\模式. 【总页数】3页(9591-9592,9611)

【关键词】棉花黄萎病;抗菌肽25a2;生物信息学;结构 【作者】巩校东;张东东;栾忠奇

【作者单位】河北农业大学生命科学学院,河北保定 071001;河北农业大学生命科学学院,河北保定 071001;大连海洋大学理学院,辽宁大连 116023 【正文语种】中文 【中图分类】S435.621 【相关文献】

1.棉花黄萎病抗茵肽25a2的生物信息学分析 [J], 巩校东; 张东东; 栾忠奇 2.牛血红蛋白源抗菌肽P3及其类似肽的生物信息学分析 [J], 李杰; 杭柏林; 秦爱建; 钱琨; 胡建和

3.鸡内源性抗菌肽LEAP-2的生物信息学分析 [J], 杭柏林; 徐军; 胡建和