水稻snoRNA47基因簇的初步鉴定

水稻snoRNA47基因簇的初步鉴定

江舸;李伟;金由辛;王德宝

【期刊名称】《生物化学与生物物理学报：英文版》 【年(卷),期】2002(034)005

【摘要】通过生物信息学分析, 在水稻染色体中发现一个新的C/D框snoRNA 基因簇. 此基因簇含有3个C/D框snoRNA基因, 它们都具有典型的C框和D框保守元件; 末端能形成茎环结构; 含有一段相同的12 nt\引导\序列, 此序列能与水稻18 S rRNA中第621位到632位的序列互补配对. 通过实验证明, 这3种snoRNA 的确存在于水稻细胞核内, 并确定出它们各自5′端的位置. 进一步对此snoRNA基因簇的表达进行研究发现, 此基因簇中的3个snoRNA基因共同转录成为一个多顺反子的前体. 将这3种新发现的水稻snoRNA分别命名为OSsnR47.1, OSsnR47.2和OSsnR47.3. 编码它们的基因已被GenBank收录, 其登录号分别为: AF453504, AF453503和AF453502. 【总页数】4页(667-670)

【关键词】C/D框snoRNA;OSsnR47基因簇;rRNA;甲基化 【作者】江舸;李伟;金由辛;王德宝

【作者单位】中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所分子生物学国家重点实验室,上海,200031;中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所分子生物学国家重点实验室,上海,200031;中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所分子生物学国家重点实验室,上海,200031;中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所分子生物学国家重点实验室,上海,200031