版纳微型猪近交系细胞色素P450家族基因CYP1A1克隆
及生物信息学分析
王淑燕;王配;霍金龙;查星琴;潘伟荣;张霞;王雪飞
【期刊名称】《云南农业大学学报》 【年(卷),期】2017(032)003
【摘要】[目的]克隆版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)细胞色素P450家族基因CYP1A1的编码区序列,并对其进行生物信息学分析.[方法]利用RT-PCR方法获得CYP1A1基因的全长CDS序列,运用生物信息学对其核酸及蛋白序列进行分析,构建系统进化树.[结果]获得的BMI CYP1A1 CDS长度为1551 bp,编码516个氨基酸,蛋白质分子量为58.39 ku,等电点为7.83,位于内质网的概率是94.1％.CYP1 A1蛋白质含有1个细胞色素P450半胱氨酸血红素配体位点,1个N-豆蔻酰化位点,1个酰胺化作用位点,2个N-糖基化位点、6个蛋白酶C磷酸化位点和5个蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点.11个物种构建的系统进化分析表明,BMI(猪)CYP1 A1与牛和山羊的关系最近.[结论]以上结果将为进一步研究版纳微型猪近交系CYP1A1基因功能奠定基础.%[Purpose] Our purpose was to clone sequence and analyze the character of the cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1 gene (CYP1A1) from Banna mini-pig inbred line (BMI).[Methods] The complete CDS of CYP1A1 gene was cloned using RT-PCR method from BMI.Nucleotide and protein sequences of CYP1A1 were utilized to carry out bioinformatics analysis and construct the phylogenetic tree.[Results] The CDS length of BMI CYP1A1 is 1 551 bp in length which encodes a
protein of 516 amino acids with molecular weight (Mw) 58.39 ku,and isoelectric point (pI) 7.83,and locates in the endoplasmic reticulum with 94.1％ reliability.CYP1A1 protein contains a cytochrome P450 cysteine heme-iron ligand signature,an N-myristoylation site,a aidation site,two N-glycosylation sites,six protease C phosphorylation sites and five protein kinase Ⅱ phosphorylation sites.Phylogenetic analysis of 11 species showed that CYP1A1 of BMI (pig) had the closest relationship with these of cattle and goat.[Conclusion] The results will lay a foundation for further study on CYP1A1 gene function in BMI. 【总页数】8页(442-449)
【关键词】细胞色素P450家族;CYP1A1基因;编码区序列;版纳微型猪近交系;生物信息学;药物代谢
【作者】王淑燕;王配;霍金龙;查星琴;潘伟荣;张霞;王雪飞
【作者单位】云南农业大学,云南省版纳微型猪近交系重点实验室,云南昆明650201;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;云南农业大学,云南省版纳微型猪近交系重点实验室,云南昆明650201;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;云南农业大学,云南省版纳微型猪近交系重点实验室,云南昆明650201;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;云南农业大学,云南省版纳微型猪近交系重点实验室,云南昆明650201;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;云南农业大学,云南省版纳微型猪近交系重点实验室,云南昆明650201;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;云南农业大学,云南省版纳微型猪近交系重点实验室,云南昆明650201;云南农业大学动
物科学技术学院,云南昆明650201;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201
【正文语种】中文 【中图分类】S828.2 【文献来源】
https://www.zhangqiaokeyan.com/academic-journal-cn_journal-yunnan-agricultural-university-natural-science_thesis/02012905544.html 【相关文献】
1.版纳微型猪近交系CPN10克隆、亚细胞定位、组织表达和生物信息学分析 [J], 宋雪; 秦彩艳; 霍金龙; 王配; 李罗刚; 张霞; 王淑燕; 王雪飞
2.茯苓细胞色素P450还原酶基因的克隆与生物信息学分析 [C], HE Hai; 何海; GUO Ji-yun; 郭继云; SHU Shao-hua; 舒少华; WANG Mo; 王沫
3.一株尖孢镰刀菌细胞色素P450氧化酶基因的克隆及生物信息学分析 [J], 单丽红; 姜冬冬; 赵沙沙; 黄佳佳; 朱丽; 刘宏民
4.茯苓细胞色素P450还原酶基因的克隆与生物信息学分析 [J], 何海; 郭继云; 舒少华; 王沫
5.雷斯青霉NADPH-细胞色素P450还原酶基因的克隆及生物信息学分析 [J], 贾龙刚; 姜海琪; 郭凯; 许喆; 刘晓光; 路福平
以上内容为文献基本信息，获取文献全文请下载
版纳微型猪近交系细胞色素P450家族基因CYP1A1克隆及生物信息学分析
