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λ噬菌体基因组DNA快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书

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杭州昊鑫生物科技股份有限公司 htpp://www.hzhxbio.com λ噬菌体基因组DNA快速提取试剂盒

目录号:DN22 目录编号 DN2201 DN2202

包装单位 50次 100次

?

适用范围:

适用于快速λ噬菌体DNA ?

试剂盒组成、储存、稳定性:

保存 -20℃ -20℃ 室温 室温 室温 室温 室温 室温 室温 室温

试剂盒组成 RNase A DNase I 噬菌体沉淀液 裂解缓冲液 杂质沉淀液 结合液LB 漂洗液WB 洗脱缓冲液EB 吸附柱AC 收集管(2ml)

50次 20 mg 50 mg 100 ml 30 ml 5 ml 20 ml

100次 20 mg X 2 50 mg X 2 100ml X 2 60 ml 10 ml 40 ml

15 ml 25 ml

第一次使用前按说明加指定量乙醇 10 ml 50个 50个

15 ml 100个 100个

本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。

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储存事项: 1.

在RNase A管和DNase I管分别加入1毫升的裂解缓冲液吹打,颠倒混匀,充分溶解RNase A和DNase I后, 按照每次使用量分装-20℃冻存,有效期6个月。 2.

结合液LB低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。 3.

避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。 ?

产品介绍:

λ噬菌体载体广泛用于文库筛选,目的克隆培养获得大量的噬菌体颗粒需要提取λ噬菌体DNA来开展测序等后续工作。λ噬菌体裂解培养物离心后的上清,首先用RNase A /DNase I混合酶消化去除残留的宿主菌DNA/RNA,沉淀收集噬菌体,噬菌体被SDS裂解,残留碎片通过沉淀离心去除掉。裂解物上清中的λ噬菌体DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将λ噬菌体DNA从硅基质膜上洗脱。 ? 1. 2.

产品特点:

不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

节省时间,简捷,可用于液体培养裂解物和固体培养板的提取,单个样品操作一般可在1.5小时内完成。 3.

产量高,典型的产量10ml λ噬菌体裂解培养物上清可以提取约10μg λ噬菌体DNA。 4.

多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9。可以直接用来酶切和测序。

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? 1. 2. 3. 4.

注意事项

使用转速可以达到13,000rpm的冷冻离心机。 开始实验前将需要的水浴先预热到37℃备用。 需要自备氯仿,20%SDS。

结合液LB含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。 ?

操作步骤:(实验前请先阅读注意事项) 以10 ml噬菌体感染细菌培养上清提取举例: 提示:

? 第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入! ? 将噬菌体沉淀液放在冰上预冷。 1.

将0.5%氯仿处理后的λ噬菌体感染的液体培养物10,000g(约12,000rpm) 4℃离心10分钟去除细胞碎片和残渣。

转速不能过高,时间不能过长,否则噬菌体可能和碎片一起沉淀,降低产量。 2.

取10ml上清,加入20μl RNase和20μl DNase充分混匀37℃温育30分钟。 每个噬菌体培养上清因生长和裂解情况不同而残留RNA/DNA量不等。RNase/DNase消化过头,可能减少产量;消化不完全,可能未消化的DNA/RNA和细胞碎片粘去部分噬菌体减低产量并/或者导致最后污染宿主菌DNA,因此应该根据实际情况适当调节用量和消化时间。 3.

加入2 ml 冰预冷的噬菌体沉淀液,轻柔充分混匀后置冰上冷却(培养板裂解物必须在冰上放置30分钟)。 4.

10,000g(12,000rpm)4℃离心10分钟,弃上清,干燥1分钟。沉淀下来的噬菌

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体外观为透亮或者稍白的沉淀。 5.

加入500μl裂解缓冲液,吹打重悬噬菌体,加入100μl 20%SDS,立即轻柔颠倒混匀4-6次后,70℃温育10分钟,然后置冰上冷却。 6.

加入100μl杂质沉淀液,立即轻柔颠倒混匀4-6次,最高速13,000g 4℃离心10分钟。 7. 8.

仔细将上清转入新的离心管,加入350μl结合液LB,轻柔涡旋混匀。

将上述混合物加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)12,000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液。

吸附柱一次最多只可以容纳大约700μl混合物,因此需要分次把混合物上到吸附柱内,重复步骤8。 9.

加入600μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃废液。

10. 可选步骤:重复步骤9一遍。

11. 将吸附柱AC放回空收集管中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免

漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

12. 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μl洗脱缓

冲液EB(洗脱缓冲液事先在 50℃水浴中预热), 室温放置1分钟,12,000rpm 离心1分钟。如果想得到较多量的DNA,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,12,000rpm离心1分钟。

洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于40μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。 13. DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。

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问题与解决方法: 问题 评论与建议 * 试剂盒储存在非最佳条件-建议:收到试剂盒后总是存放在室温(15℃-20℃)。

* 缓冲液或者试剂暴露于减少它们有效性的条件下-建议:储存在室温(15℃-20℃),每次用完后立刻盖紧盖子,以免溶液蒸发,pH改变和污染。

* 漂洗液WB中忘记加无水乙醇-建议:第一次实验时,在漂洗液WB

低核酸产量 或者纯度不高

中加入指定量无水乙醇。

* 试剂和样品没有充分混匀-建议:加入每个试剂后都要充分混匀。 * 噬菌体上清滴度太低-建议:1.确认λ噬菌体已经完全裂解了宿主菌(加入0.5%的氯仿可以帮助完全裂解);2.离心去除宿主菌碎片残渣时间不能超过10分钟,转速不超过10,000g,否则否则噬菌体也可能和碎片一起沉淀丢失;3.重新培养一次噬菌体感染细菌。 * DNase I/RNase消化不足或者过头-建议:消化过头,可能减少产量并导致最后污染宿主菌DNA;消化不完全,可能未消化的DNA,RNA和细胞碎片粘去部分噬菌体,因此可以适当调节用量。

宿主菌基因组

DNA残留过高

* DNase I/RNase失活或者反应条件不佳-建议:DNase I/RNase必须溶解在裂解缓冲液中,必须分装冻存。λ噬菌体必须用LM(含镁离子)培养,在其它培养肉汤中,DNase消化活性可能受到影响。

* 不适合的离心温度和离心力。-建议:10,000g(12,000rpm)4℃离心

加入噬菌体 沉淀剂后未见到 λ噬菌体沉淀

10分钟。

* 上清中含λ噬菌体太少-建议:离心前,样品置冰上冷却。参见前面滴度太低解决办法

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λ噬菌体基因组DNA快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书

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