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material-studio-入门教程:构建晶胞以及forcite动力学模拟

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动力学计算步骤: 一、构造分子

1:File-new-3D atomistic document-重命名

2:构建分子-右键改Display style-adjust hydrogen加氢-clean

3:优化分子-moduces-forcite-calculation-几何优化 more里面可以改参数-改任务名称

-Run

二、构建晶胞

点开优化好的分子-modules-amorphous cell-construction-添加指定分子-改number,密度,number of configurations调成1-setup-forcefield-compass-Construct 三、使分子有序排列,构建超级晶胞

先构建一个分子的晶胞-bulid- symmetry –supercell-扩大a,b-保存 四、将不同晶胞合并

将两个晶胞的参数改成一样后,Bulid-bulid layer-打开所选晶胞-layer details 调节方向-bulid

五、动力学模拟计算

第一步:Forcite-calculation-dynamic-more-NVT,number of steps和flame output every一样;温度Anderen;Energy中forcefield选择compass-Run。

第二步:Forcite-calculation-dynamic-more-NPT,压力选择0.0001Gpa(常压),number of steps和flame output every一样;thermostat选择Anderen;barostat选择Berendsen;Energy中forcefield选择compass-Run 六、分析参数

Modules-forcite-analysis 1:径向分布。 2:密度分布。

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