猪圆环病毒1型和2型四川分离株全基因克隆分析

猪圆环病毒1型和2型四川分离株全基因克隆分析

朱玲;郭万柱;徐志文;陈杨;周远成

【期刊名称】《四川农业大学学报》 【年(卷),期】2007(025)002

【摘要】参照Genbank收录猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)1、2型序列,设计两对特异性引物,分别扩增猪圆环病毒1型和2型四川分离株(PCV1-YA1株和PCV2-SC株)全基因组,获得了预期目标大小一致扩增产物,分别将其克隆于PMD18-T载体,分别命名为PMD18-T-PCV1-YA与PMD18-T-PCV2-SC.经酶切鉴定和序列测定证实,成功克隆了PCV1-YA1株1759bp和PCV2-SC株1767 bp的全基因组序列.所得序列与GenBank中的国内外其它PCV1和PCV2毒株进行比较分析,其同源性分别达到98.8%～99.9%与93.6%～98.6%;而PCV1-YA1株和PCV2-SC株之间的同源性则仅为69.2%,进一步分析两个毒株的主要阅读框架,毒株间ORF1核苷酸序列及推导的氨基酸同源性均为85.3%,而 ORF2的核苷酸序列及推导的氨基酸同源性分别为66%和65.2%.推导显示两毒株之间ORF1编码产物疏水性区域分布有相似之处,而ORF2编码产物的跨膜区存在差异.

【总页数】4页(127-130)

【关键词】猪圆环病毒;全基因;克隆;序列分析 【作者】朱玲;郭万柱;徐志文;陈杨;周远成

【作者单位】四川农业大学,动物科技学院,四川,雅安,625014;四川农业大学,动物科技学院,四川,雅安,625014;四川农业大学,动物科技学院,四川,雅安,625014;四川农业大学,动物科技学院,四川,雅安,625014;四川农业大学,动物科技学院,四