生物信息学软件的使用（以MC4R基因为例） 第一章 从NCBI上查找DNA、mRNA、蛋白质序列
一、以猪的黑素皮质素受体4(MC4R, melanocortin-4 re-ceptor)基因为例，介绍如何从NCBI上查找DNA、mRNA、氨基酸序列。
1.首先查找MC4R的DNA序列。
在百度里输入NCBI，打开后得到的结果如下网页：
在Search 栏输入 “MC4R pig”，在下拉菜单里选择Gene，然后点击Search，得到如下结果：
点击第一个ID为397359的链接，得到如下的结果：
可以看到该基因位于猪的1号染色体上，在右下方有个“Go to nucleotide”即进入核酸序列，有三种格式（用红圈标记的），经常用的是“FASTA”和“GenBank”，“FASTA”格式的比较简洁，不包含任何的数字，就全部是碱基，序列的对比和分析是就要用到这种格式；而“GenBank”格式就比较详细，可以查看到很多信息，比如碱基数、mRNA序列、内含子、外显子、CDS，以及氨基酸序列等等之类的。点击GenBank后得到如下结果：
Sus scrofa breed mixed chromosome 1, Sscrofa10.2 DNA
LOCUS NC_010443 2265 bp DNA linear CON 29-SEP-2013 DEFINITION Sus scrofa breed mixed chromosome 1, Sscrofa10.2.
ACCESSION NC_010443 REGION: complement(178553488..178555752) GPC_000000583 VERSION NC_010443.4 GI:347618793 DBLINK BioProject: PRJNA28993 Assembly: GCF_000003025.5 KEYWORDS RefSeq.
SOURCE Sus scrofa (pig) ORGANISM Sus scrofa
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Cetartiodactyla; Suina; Suidae; Sus.
COMMENT REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CM000812.4.
On Oct 11, 2011 this sequence version replaced gi:333795951. Assembly Name: Sscrofa10.2
The genomic sequence for this RefSeq record is from the genome assembly released by the Swine Genome Sequencing Consortium as Sscrofa10.2 in August 2011 (see
http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_scrofa). Sscrofa10.2 is a mixed assembly of clones and contigs from the whole-genome shotgun
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