花生FAT基因家族的全基因组分析
张会1,单雷1,李新国1,郭峰1,孟静静1,万书波2,彭振英1
【摘 要】摘要:酰基-ACP硫酯酶(fatty acyl-ACP thioesterase,FAT)是控制植物种子油脂合成的关键酶,根据其氨基酸序列和底物特异性不同可分为FATA和FATB两类。为了更深入了解花生FAT(AhFAT)的特点与功能,本研究对AhFAT家族基因进行了全基因组生物信息学分析。在花生基因组中共有20个FAT基因,不均匀分布在2个基因组的12条染色体上。20个AhFATs可以分为AhFATA和AhFATB两个亚家族,AhFATA亚家族有2个基因,AhFATB亚家族有18个基因。AhFATA家族基因具有6或8个外显子,AhFATB家族基因结构较为复杂,外显子数目5~8个;AhFATs都不具有跨膜结构域但是都具有保守的Acyl-ACP_TE结构域。对AhFAT家族基因进行可变剪接分析,发现只有少数发生了可变剪接,且具有组织特异性。对AhFATs表达模式分析的结果显示,AhFATAs和AhFATBs都在种子发育后期表达量较高。 【期刊名称】山东农业科学 【年(卷),期】2024(050)006 【总页数】8
【关键词】花生;酰基载体蛋白硫酯酶(FAT);可变剪接;表达模式
在高等植物中,脂肪酸生物合成是由位于质体中的Ⅱ型脂肪酸合成酶催化完成的[1]。该反应包括丙二酸单酰辅酶A与酰基-ACP衍生物的聚合反应,使酰基碳链以每个循环增加两个碳单位进行延伸[2]。酰基-ACP硫酯酶(fatty acyl-ACP thioesterase, FAT)终止脂肪酸合成,水解酰基和ACP之间的硫酯键,释放出游离脂肪酸和ACP[3-6]。脂肪酸被运送到细胞质中进一步酯化形成脂酰-